Candida parapsilosis est une levure champignon qui peut coloniser la peau et le tube digestif des humains et qui est généralement inoffensive. Cependant, il peut provoquer de graves infections des plaies et des tissus, notamment une septicémie potentiellement mortelle, chez les personnes immunodéprimées à la suite d’un cancer ou d’une transplantation d’organe ou souffrant de problèmes médicaux graves nécessitant une hospitalisation prolongée.
Tout comme les antibiotiques sont utilisés pour traiter les infections bactériennes, les agents antifongiques sont utilisés pour traiter les infections fongiques. Toutefois, ces dernières années, la fréquence des souches résistantes à ces médicaments a considérablement augmenté, rendant ces infections beaucoup plus difficiles à traiter.
Une équipe dirigée par le Dr Amelia Barber du groupe d’excellence « Balance of the Microverse » de l’Université Friedrich Schiller de Jena et le Dr Grit Walther du Centre national de référence pour les infections fongiques invasives (NRZMyk) a étudié une épidémie d’un multi-médicament. souche résistante et nosocomiale de ce champignon. Les chercheurs ont développé une nouvelle méthode de détection moléculaire capable de différencier rapidement et de manière rentable les souches de C. parapsilosis.
Les résultats sont publiés dans Le microbe Lancet.
Un champignon dangereux se propage
L’étude fournit une analyse génomique détaillée d’une épidémie de longue durée provoquée par C. parapsilosis résistante aux antimicrobiens dans plusieurs établissements de santé de Berlin. L’équipe de recherche a découvert qu’une seule souche génétiquement indiscernable a provoqué à elle seule 33 infections invasives entre 2018 et 2022.
Bien que leur nombre puisse paraître faible à première vue, les infections invasives nécessitent toujours des soins médicaux intensifs et entraînent de graves altérations de la qualité de vie. Ce qui est particulièrement inquiétant, c’est que l’agent pathogène s’est propagé d’une personne à l’autre et également entre différents établissements. Sa résistance aux médicaments antifongiques préférés en fait une menace sérieuse.
Il est important de noter que la souche provenant des hôpitaux de Berlin était étroitement liée à des souches déjà trouvées au Canada, au Moyen-Orient et en Asie de l’Est, démontrant ainsi la propagation mondiale de champignons résistants aux médicaments.
Développement d’un schéma de typage innovant
Dans leur étude, les chercheurs ont non seulement découvert les relations génétiques et la dynamique de transmission des souches de C. parapsilosis associées à l’épidémie, mais ont également développé une nouvelle stratégie d’identification (typage) pour cet agent pathogène. Cette stratégie de typage, connue sous le nom de Multilocus Sequence Typing (MLST), implique le séquençage de plusieurs régions d’ADN courtes pour distinguer génétiquement les souches. Cela offre une alternative moins coûteuse et plus rapide au séquençage du génome entier.
« Le programme MLST nouvellement développé permet une différenciation et un suivi rapides et rentables des souches de C. parapsilosis. Cela nous permet de réagir rapidement aux nouvelles épidémies et de contenir efficacement ce champignon souvent résistant aux médicaments. Ceci est particulièrement utile lorsque le séquençage du génome n’est tout simplement pas possible. possible en raison du coût ou du manque de connaissances locales en bioinformatique », explique le Dr Barber, chef du groupe de recherche junior en informatique fongique à l’Université de Jena.
Le Dr Walther, co-auteur de l’article et codirecteur du NRZMyk à l’Institut Leibniz pour la recherche sur les produits naturels et la biologie des infections – Institut Hans Knöll (Leibniz-HKI), ajoute : « L’étude met en évidence l’importance de reconnaître rapidement les champignons. infections et résistances possibles afin de prévenir la transmission à d’autres patients ou à d’autres établissements. Si les cliniques ne disposent pas des installations nécessaires pour effectuer elles-mêmes le MLST, elles peuvent contacter le NRZMyk si une épidémie est suspectée.
