L’Université du Minnesota intensifie les efforts pour identifier les menaces biologiques qui pourraient déclencher une épidémie, lançant un institut pour suivre les agents pathogènes infectieux répandus aux maladies au niveau génétique et surveiller les eaux usées à l’échelle de l’État.
L’Institut de l’université sur les maladies infectieuses, UMIID, sera officiellement dévoilée plus tard ce mois-ci, mais ses efforts de surveillance sont en cours. Michael Gale, directeur de l’institut, a été recruté l’année dernière à l’Université de Washington, où il a été impliqué dans l’identification du coronavirus SRAS-COV-2 au début de la pandémie Covid-19 et en développant des vaccins ou des médicaments qui l’ont contre.
L’Institut a reçu de mauvaises nouvelles à son début avec la perte de subventions de financement fédérales le mois dernier qui limitera ses partenariats mondiaux pour identifier les infections émergentes. Mais Gale a déclaré qu’il était toujours positionné pour fournir un niveau de surveillance des maladies qui diminuait ailleurs aux États-Unis en raison de coupes fédérales à la recherche scientifique et en santé publique par l’administration Trump.
« Umiid est plus que jamais nécessaire », a-t-il déclaré.
Une fonction clé sera de suivre les virus et d’autres agents pathogènes pour les mutations génétiques qui indiquent qu’elles pourraient provoquer plus d’infections ou de maladies graves. Le State Public Health Lab a utilisé une approche similaire pour suivre les variations génétiques pendant la pandémie covide, identifiant les souches virales de Delta et Omicron Coronavirus qui ont alimenté les vagues de maladies graves en 2021 et 2022.
Gale a déclaré qu’une première étape sera de surveiller les changements dans les arbovirus tels que le virus du Nil occidental qui sont répartis par des tiques et des moustiques couramment trouvés dans le Minnesota. Le Nil occidental n’a pas été autant un fléau que craint au Minnesota après sa découverte en 2002 et a provoqué 150 maladies confirmées en 2003.
Seulement 22 cas du Nil occidental ont été signalés dans l’État l’année dernière. Cependant, Gale a déclaré: « Il existe des preuves d’une nouvelle dérive génétique » qui pourrait entraîner une augmentation des infections et des maladies. Le virus Powassan, réparti principalement par les tiques de cerf, est également une préoccupation pour le Minnesota qui nécessite une surveillance plus étroite, a-t-il déclaré. Les études de modélisation examineront comment les maladies des moustiques et des tiques se sont propagées chez l’homme.
L’Institut augmentera également la surveillance du Minnesota pour les changements dans la souche H5N1 de la grippe oiseaux qui pourraient présenter davantage de menaces pour la santé humaine. Les épidémies des animaux H5N1 ont perturbé la production de volailles et de boeuf au Minnesota et ont provoqué 70 maladies confirmées aux États-Unis parmi les travailleurs qui avaient des contacts avec du bétail infecté.
La menace pour la santé humaine pourrait augmenter si le virus mute sous une forme qui se propage d’une personne à l’autre. Une telle tension pourrait émerger d’une personne infectée par la grippe saisonnière et le H5N1 en même temps.
« Nous attendions tous un réassortiment du virus de la grippe et ce que nous avons obtenu était covide. C’était très inattendu », a déclaré Gale. « Donc, la grippe des oiseaux était énorme sur notre radar. Nous pensons toujours que c’est la prochaine grande possibilité » pour un événement mondial de santé publique.
L’administration Trump au début de juin a réduit des millions de fonds fédéraux pour 10 universités, y compris le U, qui a combiné il y a cinq ans pour composer les centres de recherche sur les maladies infectieuses émergentes (CREID) et rechercher des virus ou d’autres agents pathogènes qui pourraient sauter des animaux aux humains.
Au lieu d’obtenir une prolongation du soutien fédéral, Gale a reçu un e-mail des National Institutes of Health le 5 juin indiquant que la recherche du réseau « a été considérée comme dangereuse pour les Américains et non pas une bonne utilisation du financement des contribuables. Les priorités actuelles de l’agence ne soutiennent pas ce travail ».
La lettre n’a pas élaboré, mais le réseau semble avoir été taché par les préoccupations de l’administration Trump concernant les origines de Covid-19 et les théories selon lesquelles le coronavirus a été créé grâce à des recherches de gain de fonction dans un laboratoire à Wuhan, en Chine. Dale a souligné que le réseau et le U’s Institute ne sont pas engagés dans de telles recherches, qui sont interdites aux États-Unis et implique la manipulation génétique des organismes pour améliorer leurs capacités.
Les investissements de l’U et des donateurs privés soutenir le nouvel institut et lui permettra d’ajouter de l’équipement et des scientifiques.
« Nous avions voulu être plus grand … afin que nous puissions attaquer une émergence d’un pathogène avec un bâton plus gros, mais malheureusement, nous ne pouvons pas », a déclaré Gale.
L’Institut est le deuxième ajout sur le campus, mettant le U en contradiction avec les priorités de l’administration Trump sur la science et la santé publique. Michael Osterholm de U, un expert des maladies infectieux, a utilisé un financement privé ce printemps pour lancer le projet d’intégrité des vaccins, qui est conçu pour contrer la désinformation sur les vaccins – même de l’administration de la santé de Trump – avec des preuves scientifiques sur leur fonctionnement.
L’Institut s’appuiera également sur la surveillance des eaux usées, que le Minnesota a été parmi les premiers à se développer pendant la pandémie, pour surveiller les niveaux de hausse ou de baisse de la baisse de l’État.
Une étude dans le Journal des maladies infectieuses Validé l’approche, montrant des niveaux élevés de coronavirus dans les eaux usées, a fourni une semaine ou deux d’avis à l’avance pendant la pandémie avant que les niveaux de maladie covide n’augmentent dans les villes jumelles.
AU Lab a effectué une grande partie de l’analyse des échantillons d’eaux usées soumises à partir des usines de traitement à travers l’État. La prochaine étape consiste à passer davantage de ce travail de surveillance covide au ministère de la Santé du Minnesota tandis que l’université vérifie les eaux usées pour les signes de grippe, de rougeole, de VRS ou d’autres agents pathogènes.
Les premiers signes de grippe ont émergé dans l’analyse des eaux usées de l’U 12 semaines avant le début traditionnel de la saison de grippe l’année dernière, a déclaré Mark Osborn, professeur agrégé du Center for Genome Engineering de U qui a dirigé le programme de surveillance des eaux usées de l’U. Les résultats seront signalés publiquement une fois que la recherche a validé leur précision.
Les chercheurs U étudient également des moyens de faire des tests plus rapidement et dans des appareils portables qui pourraient accélérer la découverte de maladies infectieuses dans les communautés individuelles.
Osborn a déclaré que l’étape suivante va au-delà de « Spotlight » vérifie les agents pathogènes individuels et d’identifier plutôt les signatures génétiques de tous les matériaux trouvés dans les échantillons d’eaux usées. Les résultats seraient ensuite vérifiés par rapport aux bases de données des signatures génétiques des agents pathogènes connus pour identifier ceux qui présentent une menace de santé publique.
L’objectif est « de créer un fil de triple afin que les 10, 20 ou 50 agents pathogènes des premiers, s’ils sont détectés, déclenchent une alarme », a-t-il déclaré. « Ensuite, l’étape suivante est que nous utilisons l’un des (tests) les plus ciblés pour confirmer ce résultat. »
Les autres priorités de recherche de l’Institut comprennent l’étude des raisons pour lesquelles certains agents pathogènes deviennent résistants aux antibiotiques, aux antiviraux ou à d’autres traitements et à la compréhension du rôle du système immunitaire inné du corps en réponse à l’infection.
