Un programme de détection d’épidémie innovant qui suit les virus pathogènes dans les eaux usées a identifié le virus de la rougeole dans les échantillons de Houston prélevés début janvier 2025, avant que les cas ne soient signalés. L’équipe qui a développé le programme, qui comprend des chercheurs du Baylor College of Medicine, de la School of Public Health de l’Université du Texas Health Science Center – Houston, le Houston Health Department et Rice University, ont publié leurs résultats dans le American Journal of Public Health.
Les chercheurs ont détecté le virus des eaux usées à l’aide d’une approche basée sur le séquençage, une méthode très sensible et spécifique qui analyse le matériel génétique. Cette stratégie pourrait avoir de grandes implications pour la santé publique, en particulier en tant que système de surveillance sentinelle pour détecter les virus avant que des épidémies généralisées ne se produisent. Les résultats sont pertinents et opportuns à mesure que les cas de rougeole augmentent au Texas et au reste du pays et que l’étude offre une stratégie prometteuse pour devancer les épidémies potentielles.
« En 2023, nous avons montré que le séquençage systématique du matériel génétique dans les eaux usées révèle des changements dynamiques dans les virus humains circulant dans une communauté.
« Surtout, l’analyse de ces changements viraux dans les eaux usées peut améliorer notre compréhension des épidémies et de la transmission et éclairer la préparation à la santé publique, tout comme l’on utilise des données météorologiques pour mieux comprendre et prédire les conditions météorologiques pour anticiper des conditions potentiellement dangereuses », a déclaré l’auteur co-correspondant Dr Anthony Marensso, Joseph Melnick doté et professeur en virologie moléculaire et microbiologie à Baylor.
Dans la présente étude, les chercheurs ont rapporté que leur programme de surveillance des eaux usées avait détecté le virus de la rougeole dans des échantillons prélevés le 7 janvier dans deux installations de traitement de l’eau de Houston desservant plus de 218 000 résidents. Une enquête parallèle a confirmé le 17 janvier le virus de la rougeole dans deux voyageurs résidant dans la même zone desservis par les usines d’échantillonnage de traitement de l’eau.
« Dans de tels cas, notre prochaine étape est toujours de valider le signal avec une deuxième méthode, et nous avons pu le faire grâce à une collaboration avec le Houston Health Department and Rice University », a déclaré le co-premier auteur Sara Javornik Cregeen, professeur adjoint au Alkek Center for Metagenomics and Microbiome Research à Baylor. « Ils ont testé la présence du virus dans des échantillons du même site de date et de collecte et ont confirmé le signal en utilisant une autre technique, PCR. »
« Comme référence, les échantillons d’évacuation 821 de Houston que nous avons séquencés de la même zone étaient négatifs pour le virus de la rougeole au cours des 31 mois précédents », a-t-elle ajouté.
« Parce qu’aucun autre cas n’a été signalé et que les détections se sont produites dans la même zone où les voyageurs résidaient, il est raisonnable de supposer que le signal de la rougeole détecté dans les eaux usées provient des deux cas infectés, ce qui souligne la sensibilité élevée de la méthode », a déclaré Maresso.
« Avec les leçons tirées de l’événement de détection de la rougeole de Houston, nous travaillons maintenant avec nos partenaires de santé publique pour recueillir des données sur l’épidémie actuelle de la rougeole dans l’ouest du Texas. Bien que non signalé ici, notre programme a suivi la rougeole dans les eaux usées de ces sites, en espérant que les informations peuvent aider les responsables à prendre ce virus », a déclaré le co-anteau de la co-donorale, le Dr Baylor.
Actuellement, les chercheurs ne détectent pas les virus de la rougeole dans les eaux usées à Houston mais le détectent dans les villes de l’ouest du Texas. L’équipe continue d’enregistrer l’activité hebdomadaire des virus possibles et de signaler les résultats dans le premier tableau de bord de la santé basé sur le séquençage qui est accessible au public sur https://tephi.texas.gov/early-detection.
Le Dr Eric Boerwinkle, doyen de la Uthealth Houston School of Public Health and Co-Corresponding auteur, a déclaré que « ce travail souligne la capacité des analyses sophistiquées des eaux usées pour servir de système de détection précoce bénéficiant de la santé publique, des soins de santé et des communautés dans la prévention d’une épidémie de rougeole à Houston. »
Il continue en nous rappelant que « la meilleure protection contre la contraction du virus de la rougeole est le vaccin ROR, qui s’est avéré sûr et efficace ».
