Des chercheurs du Texas Biomedical Research Institute et de l’Université de Chicago ont découvert un mécanisme que SARS-COV-2, le virus qui provoque Covid-19, utilise pour se protéger à l’intérieur du corps lorsqu’il travaille pour reproduire et infecter plus de cellules. Sans ce mécanisme de protection, l’infection virale est considérablement réduite.
La découverte, publiée dans Communications de la naturenon seulement fournit une cible potentielle pour les nouvelles thérapies Covid-19, mais offre également des informations qui pourraient éclairer les vaccins futurs et le développement antiviral. L’étude s’appuie sur des travaux antérieurs de Texas Biomed qui ont identifié les protéines virales qui sont les plus importantes pour la pathogénicité du virus ou la capacité de provoquer une maladie.
« En 2021, nous avons constaté que la protéine accessoire ORF3A est l’une des protéines les plus importantes pour le virus et lorsque nous l’assocons, le virus devient beaucoup moins nocif – mais nous ne savions pas pourquoi », a déclaré le scientifique du personnel de Texas Biomed, Chengjin Ye, Ph.D. « Maintenant, en travaillant avec nos collaborateurs à l’Université de Chicago, nous comprenons le mécanisme. »
Un détail de sécurité dense
Plus précisément, SARS-COV-2 ORF3A semble jouer un rôle vital dans la protection des protéines structurelles, notamment la protéine de pointe qui facilite la propagation dans d’autres cellules, car elles sont assemblées à la surface des particules virales. Il le fait en conduisant la formation d’un groupe dense de protéines qui entourent la protéine de pointe et offrent une protection pendant le transport, un peu comme les détails de sécurité protégeant une personne ou un véhicule blindé transportant de l’argent à la banque.
L’équipe de Chicago, dirigée par le professeur adjoint Jueqi Chen, Ph.D., a qualifié ces complexes de protection des « corps denses » ou 3DB pour faire court.
Il semble que les 3DB aident à empêcher la coupe de la protéine de pointes en composants plus petits. Lorsque ORF3A est manquant, ces 3DB ne se forment pas et la protéine de pointe arrive souvent endommagée, notant gravement la capacité du virus naissant à infecter de nouvelles cellules.
« ORF3A pourrait donc être une bonne cible pour les médicaments pour bloquer le virus », a déclaré le professeur Texas Biomed, Luis Martinez-Sobrido, Ph.D. « Cette découverte pourrait également être déterminante pour le développement des vaccins, comme nous l’avons illustré précédemment. »
Une évolution surprise
Étant donné que le gène ORF3A est présent dans d’autres coronavirus, l’équipe était curieuse si ces virus ont également déclenché la formation de 3DBS. Ils ont constaté que les 3DB sont formés par des coronavirus connexes portés par les chauves-souris et les pangolins. Cependant, il était surprenant de constater que les sars-
Le COV et les coronavirus trouvés dans les civettes ne le font pas, ce qui pourrait aider à expliquer les taux de transmission et d’infection inférieurs au cours de l’épidémie de SRAS 2003 par rapport à la pandémie Covid-19. Selon l’Organisation mondiale de la santé.
La recherche est un bon exemple de collaboration multidisciplinaire: l’expertise du Dr Chen en biologie cellulaire et microscopie à haute résolution a complété l’expérience de la virologie et de l’ingénierie virale des DR. Ye et Martinez-Sobrido.
« Après avoir identifié les structures 3DB et conduit les résidus des pièces ORF3A critiques pour l’assemblage 3DB, nous avons collaboré avec les Drs. Ye et Martinez-Sobrido pour concevoir un virus atténué sans capacité de former 3DB », a déclaré le Dr Chen. « Les coronavirus ont les génomes les plus importants parmi les virus de l’ARN et donc l’expertise de génétique inverse des Drs. Ye et Martinez-Sobrido ont été essentiels pour les études fonctionnelles de 3DB pendant l’infection. »
Maintenant qu’ils ont identifié pourquoi ORF3A est si important, les deux laboratoires aimeraient creuser plus profondément et déterminer ce qui brise la protéine de pointe lorsqu’il est laissé non protégé, ce qui pourrait révéler une autre avenue pour le développement thérapeutique. Ils aimeraient également étudier d’autres variantes SARS-COV-2 pour voir si les mutations du gène ORF3A affectent la formation de 3DB et les taux d’infection.
