Selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS), des centaines de millions de nouveaux cas d’infections bactériennes transmissibles sexuellement (IST) sont signalées dans le monde chaque année. De nombreuses infections ne sont pas diagnostiquées en raison de leurs symptômes souvent silencieux, contribuant à la transmission, aux maladies et aux complications telles que l’infertilité et la fausse couche.
La lutte contre le défi Global STI des bactéries qui provoque la chlamydia, la gonorrhée, la syphilis et aussi le mycoplasma génital restent un problème de santé publique important. Avec l’augmentation des taux d’infection et l’augmentation de la résistance aux antimicrobiens, la compréhension de ces agents pathogènes est vitale pour améliorer les stratégies de diagnostic, de traitement et de prévention.
Le défi de comprendre les IST
Étudier les bactéries derrière les IST est notoirement difficile. Beaucoup de ces agents pathogènes ne peuvent pas être cultivés dans des laboratoires, et les échantillons cliniques contiennent des quantités écrasantes d’ADN humain, faisant du séquençage du génome des IST bactériennes une tâche intimidante. Cependant, le génome contient les informations génétiques de ces bactéries, y compris la façon dont elles sont liées les unes aux autres et leur résistance aux antibiotiques.
Une équipe de scientifiques dirigée par Helena Seth-Smith de l’Université de Zurich (UZH), en Suisse, avec une collaboration internationale avec l’Université de Buenos Aires, en Argentine, a développé une technologie de pointe « Enrichissement cible ». En utilisant des sondes moléculaires spécialement conçues, ils ont « pêché » pour l’ADN de STI bactérien à partir d’échantillons cliniques, permettant une analyse du génome à haute résolution.
« Cette méthode nous aide à comprendre comment Chlamydia se propage et s’adapte », explique Helena Seth-Smith, co-responsable de la génomique microbienne et chef de la bioinformatique à l’Institut de microbiologie médicale.
Découverte d’une nouvelle lignée de chlamydia
L’équipe a découvert une lignée auparavant inconnue de Chlamydia trachomatis en Argentine. Cette nouvelle souche « Ompa-Génotype L4 », qui a différentes caractéristiques génétiques des trois souches connues, a été trouvée dans des échantillons rectaux d’hommes qui ont des relations sexuelles avec des hommes. Les résultats sont publiés dans deux articles de la revue Génomique microbienne.
La chlamydia est principalement transmise à travers les muqueuses pendant des relations sexuelles non protégées. Les patients atteints de lignée L4 présentaient généralement des symptômes tels que l’inflammation rectale, des selles difficiles ou urgentes et une sortie rectale.
« Nos résultats ouvrent une nouvelle frontière dans la compréhension des IST et mettent l’accent sur la nature dynamique des voies de transmission et de développement des IST », a déclaré Karina Büttner de UZH. « Avec ces outils, nous pouvons mieux soutenir les efforts de santé publique pour contrôler et prévenir ces infections. »
La coopération globale dans le suivi de ces infections est essentielle. Les maladies sexuellement transmissibles affectent souvent les groupes de population ayant peu ou pas d’accès aux soins de santé ou à l’éducation.
Selon les chercheurs, les nouvelles méthodes et une meilleure compréhension de la composition génétique des agents pathogènes permettra d’identifier les tendances de la résistance aux antibiotiques, d’améliorer les tests de diagnostic et les traitements d’adaptation à la menace croissante posée par les IST.
