Un nouveau modèle a examiné les nombres associés à la détection et à la contenu d’une épidémie potentielle du virus de la fièvre porcine africaine (ASFV) aux États-Unis et a constaté que l’échantillonnage et la capacité de laboratoire sont des domaines de préoccupation, en particulier dans des zones à des populations de ferme denses – lorsque des échantillons sont testés dans l’État. La recherche est publiée dans la revue Médecine vétérinaire préventive.
L’ASFV est une maladie virale très contagieuse chez les porcs, avec un taux de mortalité qui peut atteindre 100%. Les porcs infectés peuvent ne pas montrer de symptômes avant de mourir, permettant potentiellement au virus de se propager avant sa détection. Le coût d’une épidémie potentiel de l’ASFV aux États-Unis a été estimé à 80 milliards de dollars.
« La clé de la gestion d’une épidémie ASFV est de tester et de contenir l’infection », explique Jason Galvis, chercheur à la North Carolina State University. « Mais dans les zones avec des populations de ferme denses, faire les tests en temps opportun peut être difficile. Nous avons examiné les protocoles actuels et modélisé ce qui pourrait arriver lors d’une épidémie. »
Lors d’une épidémie, les responsables de la santé doivent se rendre dans les fermes et prélever des échantillons de sang qui sont envoyés aux laboratoires pour les tests. Pour éliminer la possibilité que les preneurs d’échantillons puissent transporter la maladie de la ferme à la ferme, ils doivent attendre 72 heures entre les visites d’échantillonnage.
Le modèle, réparti par le cochon, a utilisé des données de population et de mouvement à partir d’un état de porc densément peuplé pour simuler la propagation de l’ASFV dans des scénarios d’épidémie à la fois grands et petits. Dans l’ensemble, le modèle a généré une médiane de 27 épidémies en 150 jours. Pour le scénario d’épidémie médian, le sang et les échantillons oraux ont dû être prélevés sur des porcs dans plus de 3 000 granges.
En supposant que 31 échantillons par étable sont nécessaires pour la surveillance de l’ASFV et, à des exigences de temps d’arrêt, pour les échantillonneurs, le nombre le plus bas de personnel nécessaire pour obtenir des échantillons sans retarder le processus variait entre 136 et 367, mais ce nombre pourrait augmenter entre 833 et 3 115 dans de grands scénarios épidémiques. Dans l’ensemble, les chercheurs ont estimé que dans 50% des scénarios d’épidémie, au moins 238 collectionneurs d’échantillons seraient tenus de faire le travail.
La capacité de laboratoire était également une préoccupation, car seuls les laboratoires spécifiques ont la capacité de traiter ces échantillons. Le modèle a plafonné la capacité quotidienne de laboratoire dans la zone d’étude à 1 000 échantillons par jour. Le retard médian de traitement sans regroupement d’échantillons était de 92 jours, ce qui a atteint un maximum de cinq ans dans les pires scénarios. La mise en commun des échantillons combine des échantillons d’une grange à un seul test, et cet échantillon est testé en premier. Si cet échantillon regroupé est négatif, tous les membres de la piscine peuvent recevoir un résultat négatif.
Les chercheurs ont noté que les facteurs d’atténuation potentiels, tels que la réduction des temps d’arrêt pour les échantillonneurs de 72 à 24 heures et l’utilisation d’échantillons oraux en plus des échantillons de sang ont diminué le temps d’échantillonnage, et la mise en commun des échantillons a soulagé une partie de la pression sur les laboratoires. Cependant, la faisabilité de ces approches devrait être évaluée davantage, car, par exemple, il y a encore des questions entourant l’efficacité de l’échantillonnage oral.
« Bien qu’il y ait des limites au modèle, le principal point à retenir est que nous devons examiner de près nos stratégies d’échantillonnage actuelles pour améliorer notre préparation avant une épidémie », explique Galvis.
