Une nouvelle étude d’observation rétrospective basée sur le laboratoire fournit des informations détaillées sur les causes des fièvres d’origine inconnue en Afrique subsaharienne. Avec des scientifiques de la Guinée et de la Slovaquie, des chercheurs du Centre allemand du Centre de recherche sur les infections (DZIF) de Charité – Universitätsmedizin Berlin ont examiné 550 patients de Guinée qui ont développé une fièvre persistante au moment de l’épidémie d’Ebola majeure en 2014, mais qui a été testé négatif pour le négatif pour le négatif pour le négatif pour le négatif pour le négatif pour la Virus Ebola sur place.
L’objectif était d’utiliser des méthodes de diagnostic modernes pour mieux comprendre les maladies infectieuses sous-jacentes. L’étude est publiée dans Le Journal of Infectious Diseases.
La fièvre est un symptôme courant de nombreuses maladies, notamment les infections, le cancer et les maladies auto-immunes. Lorsque la cause d’une fièvre persistante reste claire malgré une enquête approfondie, elle est appelée fièvre d’origine inconnue (FUO). Environ la moitié de tous les cas Fuo dans le monde ne restent pas diagnostiqués.
En Afrique subsaharienne, le paludisme est souvent suspecté et traité sans confirmation de laboratoire ni enquête plus approfondie. Cependant, 90 millions d’hospitalisations pédiatriques par an en Afrique subsaharienne sont dues à des fièvres non causées par le paludisme mais par d’autres infections, souvent en raison de diverses bactéries et virus.
Une équipe de recherche du Centre allemand du Centre de recherche sur les infections (DZIF) et de Charité – Universitätsmedizin Berlin, en collaboration avec des scientifiques de la Guinée et de la Slovaquie, a mené une étude observationnelle rétrospective pour étudier approfondie la diversité pathogène des patients de la Guinée avec une fièvre de cause inconnue au cours d’une Major Ebola épidémie en 2014. Ils ont combiné des données épidémiologiques, phylogénétiques, moléculaires, sérologiques et cliniques.
À l’aide de tests sérologiques, de la PCR et du séquençage à haut débit, au moins un agent pathogène a été détecté chez 275 des 550 patients. En plus des plasmodes parasites du paludisme attendus, des bactéries pathogènes telles que les souches de salmonelle et de klebsiella ont été détectées dans près d’un cinquième des patients.
La détection fréquente de la résistance aux soi-disant antibiotiques de première ligne dans les échantillons examinés et le taux élevé de co-infections étaient également inquiétants: 1 patients infectés sur 5 avait plusieurs infections en même temps. Les agents pathogènes provoquant un paludisme et une septicémie bactérienne étaient particulièrement courants, se produisant ensemble chez 12% des adultes et 12,5% des enfants.
Les infections à virus hautement pathogènes étaient également courantes: la fièvre jaune, les virus Lassa et Ebola ont été détectées par RT-PCR chez environ 6% des patients. Il convient de noter en particulier la détection de l’infection par le virus orungo, un agent pathogène peu connu pour lequel il n’y a pas de tests robustes.
À l’aide de tests d’immunofluorescence, les chercheurs ont également identifié des anticorps IgM contre plusieurs virus, notamment la dengue, le Nil occidental et les virus de fièvre hémorragique de Crimean-Congo, chez les patients négatifs par PCR.
« En Afrique, les maladies fébriles de cause inconnue sont souvent reconnues et traitées comme un paludisme sans autre diagnostic. Dans notre étude, nous avons pu détecter un agent pathogène chez environ la moitié de tous les patients atteints de FUO, y compris des agents pathogènes bactériens qui provoquent une septicémie, des virus de fièvre hémorragique y compris Ebola et, comme prévu, diverses souches du parasite du paludisme Plasmodium, « explique le dernier auteur de l’étude, le professeur Jan Felix Drexler.
Les résultats soulignent le besoin urgent de renforcer davantage la capacité de laboratoire en Afrique subsaharienne. La détection précoce des causes infectieuses de FUO est essentielle aux soins aux patients, à une réponse efficace aux épidémies et au développement de diagnostics régionaux appropriés.
« Nos résultats montrent que les schémas thérapeutiques adaptés à la région doivent être discutés, que le contrôle de la qualité dans le contexte des épidémies doit être renforcé et que la connaissance du spectre pathogène peut guider le renforcement ciblé des laboratoires régionaux et la recherche translationnelle au sens du point de point de -Care Tests, « Drexler résume.
Fourni par Deutsches Zentrum Für Infektionsforschung
