Une dénomination inexacte des maladies génétiques a pour conséquence que certaines maladies génétiques rares ne sont pas inutilement diagnostiquées, préviennent les scientifiques de l’Université de Manchester. UN Génétique naturelle Le document de communication publié aujourd’hui s’ajoute aux données existantes selon lesquelles environ 6 000 enfants britanniques atteints de maladies rares par an ne reçoivent jamais de diagnostic, beaucoup mourant sans savoir ce qui les a causées.
Les chercheurs soulignent également les recherches existantes qui calculent le coût des longs voyages de diagnostic des maladies génétiques rares vers le NHS à plus de 3 milliards de livres sterling par décennie. Les généticiens hospitaliers s’appuient sur des preuves publiées pour poser des diagnostics, mais en raison de la dénomination incohérente des variantes, affirment les auteurs, ils sont souvent incapables de localiser les informations pertinentes, même si elles existent.
De nombreux généticiens, disent-ils, utilisent une nomenclature plus simple mais moins précise, empêchant des bases de données comme ClinVar et la Leiden Open Variation Database (LOVD) d’identifier correctement et d’ajouter de la littérature à leurs dossiers.
Cependant, un système appelé VariantValidator, conçu par des chercheurs de l’Université de Leicester et désormais basé à l’Université de Manchester, est utilisé par les principales revues médicales pour donner à chaque variante un nom standardisé. Cela permet de partager et de trouver des preuves de diagnostic. Dans le document de communication, les auteurs exhortent les médecins à utiliser le système pour nommer les variantes génétiques.
Bien que les maladies rares, causées par des variations dans les séquences d’ADN, touchent moins d’une personne sur 2 000, le nombre de maladies génétiques rares, soit environ 8 000, affecte environ 8 à 10 % des naissances dans le monde.
L’auteur principal, le Dr Peter Freeman de l’Université de Manchester, dont le fils souffre d’une maladie génétique non diagnostiquée, est le scientifique principal de l’équipe qui a conçu et développé VariantValidator. Il a déclaré : « Il est largement reconnu que les médecins décrivent souvent les variantes de l’ADN en utilisant divers systèmes de dénomination obsolètes ou non standard. Mais la dénomination précise des variantes est cruciale afin que les médecins puissent les référencer et poser un diagnostic aux patients atteints d’une maladie génétique.
« Malheureusement, de nombreuses personnes, y compris mon fils, n’ont pas reçu le diagnostic dont elles ont besoin, ce qui a des implications difficiles pour elles. Par exemple, sans diagnostic, il peut être très difficile d’obtenir une place dans une école appropriée ou d’accéder à une école dont ils ont désespérément besoin. services.
« C’est exaspérant de savoir que quelqu’un a peut-être identifié le variant qui a causé sa maladie, mais ne l’a peut-être pas nommé correctement, donc il n’y a aucun moyen de le trouver. »
Il a ajouté : « VariantValidator existe depuis 7 ans et est considéré comme la référence en termes de dénomination précise des variantes génétiques afin que d’autres cliniciens puissent trouver la définition et les utiliser. Mais dans un grand nombre de cas, cela ne se produit tout simplement pas. car il est plus facile et plus rapide de prendre des raccourcis ou de s’appuyer sur des systèmes obsolètes reconnaissables uniquement dans des disciplines cliniques spécifiques.
« Le problème est si répandu que j’ai même rencontré des experts chargés d’établir des normes cliniques qui faisaient ces erreurs lorsqu’ils nommaient des variantes dans des directives politiques axées sur la génétique. Notre travail porte sur le génome humain, mais la nomenclature des variantes génétiques des virus et autres agents pathogènes est également non standardisés – et c’est également un problème qui doit être résolu.
« La nomenclature devrait décrire avec précision les changements dans le séquençage de l’ADN observés lorsqu’il existe une variante par rapport à une séquence standard. Mais dans de nombreux cas, cela ne se produit tout simplement pas et fait partie d’un ensemble complexe de problèmes qui entraînent des diagnostics manqués ou manqués. «
