Aux États-Unis, environ une femme sur trois âgés de 14 à 49 ans développent un déséquilibre bactérien vaginal connu sous le nom de vaginose bactérienne (BV) au cours de leur vie. BV se caractérise par des odeurs désagréables et des effets secondaires potentiellement douloureux, ainsi que le risque de problèmes de santé associés plus tard dans la vie. Plus de la moitié des patients qui demandent des soins médicaux ne répondent pas au traitement de première ligne, l’antibiotique métronidazole, conduisant à une récidive.
Maintenant, les chercheurs de Drexel ont développé un test de laboratoire simple basé sur la PCR ADN – construit sur une analyse génétique plus détaillée du groupe principal d’organismes bactériens qui provoquent l’infection – pour aider les cliniciens à prescrire le bon médicament pour chaque patient. Les résultats sont publiés cette semaine dans la revue Médecine du génome.
« Si ce test devient disponible pour les patients, ils peuvent éviter de prendre le mauvais antibiotique, en évitant des effets secondaires potentiels supplémentaires et des coûts financiers », a déclaré l’auteur principale Katherine Innamorati, Ph.D., instructrice du Drexel University College of Medicine. « Un traitement plus rapide et une meilleure gestion des antibiotiques sont particulièrement importants pour les patients qui peuvent avoir besoin de suivre plusieurs cours d’antibiotiques pour éliminer pleinement l’infection. »
Les principaux agents pathogènes bactériens associés à BV sont un groupe d’espèces bactériennes apparentées auparavant connues sous le nom de Gardnerella vaginalis. Des travaux antérieurs de Garth Ehrlich, Ph.D., professeur de microbiologie et d’immunologie au Collège de médecine, et des collègues ont révélé que ce groupe était en fait composé de plusieurs espèces.
Dans l’article actuel, les auteurs ont construit cet « arbre généalogique » beaucoup plus loin. Utilisation du séquençage du génome et des mesures génomiques sur 129 Gardnerella spp. Genomes, l’équipe a effectué une analyse détaillée révélant une diversité beaucoup plus grande, notamment en identifiant 11 groupes uniques d’organismes appelés génospécies, qui se situent dans plusieurs clades ou groupes majeurs.
En utilisant ces données, l’équipe de recherche a constaté que deux des clades sont composés de cinq génospécies qui sont 100% résistantes au métronidazole, mais peuvent être traitées avec succès avec la clindamycine antibiotique. Les deux médicaments sont généralement pris pendant une semaine et peuvent être administrés par voie vaginale ou par voie bouche. Le test de PCR de l’équipe peut distinguer les souches, identifiant celles qui sont très résistantes au métronidazole.
Les patients symptomatiques peuvent éprouver des démangeaisons vaginales, des brûlures pendant la miction, une odeur nauséabonde ou une sortie gris, blanche ou verte. BV n’est pas considéré comme une infection strictement transmissible sexuellement, mais certaines activités sexuelles, notamment à ne pas utiliser de préservatif, et d’autres activités peuvent augmenter la probabilité de développer BV.
On estime que la moitié des cas BV ne montrent aucun symptôme notable, ce qui entraîne de nombreux cas non traités. Bien qu’environ 30% des cas de BV se résolvent sans traitement, ceux qui ont des cas non traités peuvent être plus à risque d’infections sexuellement transmissibles, une plus grande probabilité de complications de la grossesse et d’autres impacts négatifs sur la qualité de vie résultant de l’inflammation de la muqueuse dans le tractus reproducteur.
« BV est une dysbiose, ce qui signifie que le microbiome entier du tractus reproductif inférieur est déséquilibré », a déclaré Ehrlich. « Il est possible que certains patients aient besoin des deux médicaments – le métronidazole puisse assurer la couverture de certains micro-organismes, en particulier les bactéries anaérobies qui se développent en l’absence d’oxygène. Ainsi, ceux qui ont une gardnerella résistant au métronidazole peuvent bénéficier d’un traitement à l’aide de médicaments antibiotiques, mais davantage de recherches sont nécessaires pour découvrir. »
Les chercheurs ont déposé un brevet pour le test. Un laboratoire commercial serait nécessaire pour offrir cela largement aux patients. La demande des patients et des groupes de soutien aux patients peut aider à influencer lorsqu’un tel test deviendrait disponible. À l’heure actuelle, le test peut aider à exclure le traitement du métronidazole basé sur des souches très résistantes, et l’équipe vise à étendre ses capacités pour identifier également les souches qui ont une faible résistance au métronidazole.
L’équipe travaille également à déterminer quel (s) gène (s) provoque un phénotype résistant.
« Il est possible que l’expression d’un gène puisse jouer un rôle dans la résistance à un antibiotique, ou aider à expliquer un aspect de la façon dont cette résistance se produit, mais nos données suggèrent que la résistance au métronidazole se produit à travers de multiples mécanismes, plutôt qu’un modèle clair », a déclaré Ehrlich. « Il reste beaucoup de travail à mieux comprendre les mécanismes par lesquels différents groupes d’organismes génétiques deviennent résistants au métronidazole. »
Nouvelles données d’essai contrôlées randomisées publiées ce mois-ci dans le Journal de médecine de la Nouvelle-Angleterre a suggéré que les femmes atteintes de BV qui sont dans une relation monogame avec un partenaire masculin peuvent avoir une plus faible probabilité que BV revienne après 12 semaines si elle prend les antibiotiques de première ligne tandis que son partenaire masculin prend également l’antibiotique et applique une crème de clindamycine antimicrobienne topique.
Les auteurs supplémentaires de l’étude incluent Joshua P. Earl, Shirley C. Barrera, Rachel L. Ehrlich, Josephine Aiyeku et Ari Gordon de Drexel, Evan Powell de l’Université de Pittsburgh Medical Center, Adam C. et Sharon L. Hillier de l’Université de Pittsburgh.
