L’approche «génomique-première» peut identifier des troubles génétiques rares plus tôt

Une approche «en avant-première» du dépistage des troubles génétiques rares – identifiant des variantes génétiques spécifiques, puis étudiant les traits et symptômes associés – peut identifier ces conditions plus tôt et plus fréquemment que les tests génétiques standard entraînés par les symptômes cliniques, a révélé une étude de Geisinger.

Les troubles génétiques rares (RGD) affectent au moins 24 millions de personnes aux États-Unis, soit plus de 5% de la population totale. Le diagnostic de RGD a historiquement résulté d’une approche « phénotype-première », dans laquelle les personnes présentant des symptômes cliniques sont référées pour des tests génétiques afin d’identifier une cause sous-jacente. Cette approche peut sous-estimer la prévalence de la RGD, car les personnes présentant des symptômes moins graves, ou aucun symptôme, sont moins fréquemment référées pour les tests génétiques.

Pour leur étude, l’équipe Geisinger a développé une liste de 2 701 RGD qui ne sont pas systématiquement dépistées au niveau de la population, puis ont créé une stratégie pour identifier les variantes de la maladie dans cette liste de gènes au sein d’un groupe de 218 680 participants à Mycode Community Health Initiative de Geisinger.

L’équipe de recherche a développé et appliqué des méthodes automatisées pour comparer les résultats génomiques des participants aux diagnostics cliniques existants, qu’ils ont définis comme «ajustement diagnostique» (DXFIT). Ils ont découvert que 2,5% de ce groupe avait un changement génétique de confiance élevée pour un RGD, mais l’évaluation DXFIT a révélé que la majorité de ces personnes n’avaient pas de preuves d’un diagnostic clinique correspondant dans leur dossier de santé électronique.

L’étude a été publiée en ligne cette semaine dans The American Journal of Human Genetics.

« Cette constatation importante suggère que l’utilisation d’une approche génomique d’abord peut identifier beaucoup plus de personnes souffrant de troubles rares plus tôt et peut également signifier que les chances de tomber malades de ces changements génétiques sont plus faibles qu’on ne le pensait précédemment », a déclaré Kyle Retter, MS, chef des sciences des données chez Geisinger et auteur principal de l’étude.

« L’utilisation d’une approche génomique d’abord offre le potentiel d’un diagnostic antérieur et plus précis, d’une gestion et d’un traitement améliorés, et une description plus précise des symptômes de troubles génétiques rares, qui pourraient tous contribuer à de meilleurs résultats. »