Des scientifiques japonais développent une nouvelle méthode de détection des variantes du SRAS-CoV-2

Des chercheurs de l’Université de Kumamoto ont réalisé une avancée significative dans la lutte contre le COVID-19 en développant « Intelli-OVI, » un outil de diagnostic de pointe capable d’identifier rapidement les variantes émergentes du virus SARS-CoV-2.

L’ouvrage est publié dans la revue Médecine de la communication.

Ce nouveau système combine une technologie avancée de détection de l’ADN avec des algorithmes informatiques pour offrir une méthode plus rapide et plus rentable de surveillance des mutations virales, qui pourraient jouer un rôle crucial dans la gestion des futures pandémies.

Une nouvelle ère dans la détection des virus

À mesure que la pandémie de COVID-19 progresse, malgré l’augmentation de la vaccination et l’immunité collective contre les infections passées contribuant à une diminution des cas graves par rapport aux premiers stades, de nouveaux variants du virus SARS-CoV-2 sont apparus, posant des défis importants au public. surveillance et réponse sanitaires.

Les méthodes traditionnelles, comme le séquençage du génome entier (WGS), bien que précises, prennent du temps et sont coûteuses. Intelli-OVI offre une alternative plus rapide, combinant la technologie de micro-disque IntelliPlex avec un algorithme innovant, l’identification objective des variantes (OVI), pour détecter et différencier plus de 20 variantes du SRAS-CoV-2 avec une grande précision.

« Notre système peut être facilement mis à jour pour suivre les nouvelles mutations virales, » a déclaré le professeur Yorifumi Satou, chercheur principal du Centre commun de recherche sur les infections à rétrovirus humains (JRCHRI), Université de Kumamoto. « Cette adaptabilité est cruciale pour la détection précoce des variants émergents, permettant ainsi d’agir rapidement pour empêcher leur propagation. »

Comment fonctionne Intelli-OVI

La technologie IntelliPlex utilise des microdisques, imprimés avec un motif pictural unique (πCode), pour capturer et analyser des mutations génétiques spécifiques du virus. Cela permet au système de traiter plusieurs mutations virales simultanément, accélérant ainsi considérablement le processus de détection. L’algorithme OVI interprète ensuite les données, identifiant les variantes connues et nouvelles en analysant les modèles de mutation uniques.

Lors de tests en laboratoire, Intelli-OVI a identifié avec succès plus de 20 variantes, dont plusieurs sous-types de la variante omicron, en utilisant 35 sondes ADN différentes. Contrairement aux méthodes traditionnelles basées sur la PCR, qui se limitent à détecter un petit nombre de mutations, Intelli-OVI peut théoriquement analyser jusqu’à 100 sites de mutation virale à la fois, ce qui en fait l’un des outils de diagnostic les plus complets disponibles.

Regarder vers l’avenir

Grâce au développement réussi d’Intelli-OVI, l’Université de Kumamoto est sur le point de contribuer de manière significative à la préparation mondiale à une pandémie. L’équipe de recherche espère que cette technologie pourra être appliquée à d’autres virus à évolution rapide, fournissant ainsi un outil essentiel pour les efforts de détection précoce et de confinement.

« Ce nouvel outil de diagnostic a le potentiel de révolutionner la façon dont nous surveillons les mutations virales, non seulement pour le COVID-19, mais également pour les futures pandémies. » ajouta le professeur Satou.