Les mégadonnées commencent à casser le cas froid de l’endométriose

Les scientifiques de l’UCSF ont découvert que l’endométriose – une maladie chronique douloureuse affectant 10% des femmes qui ne sont souvent pas diagnostiquées – se produit souvent parallèlement aux conditions comme le cancer, la maladie de Crohn et la migraine.

La recherche pourrait améliorer la façon dont l’endométriose est diagnostiquée et, finalement, comment elle est traitée; Et il peint le portrait le plus net à ce jour d’une condition aussi mystérieuse que prévalable.

L’étude, qui est apparue dans Cell rapporte la médecineutilisé des méthodes de calcul développées à l’UCSF pour analyser les dossiers anonymisés des patients collectés dans les six centres de santé de l’Université de Californie.

« Nous avons maintenant les outils et les données pour faire une différence pour l’énorme population qui souffre de l’endométriose », a déclaré Marina Sirota, Ph.D., directrice par intérim du UCSF Bakar Computational Health Sciences Institute (BCHSI), professeur de pédiatrie, et auteur principal du journal. « Nous espérons que cela pourra stimuler un changement de mer dans la façon dont nous abordons ce trouble. »

Les données de santé UC apportent une force en nombre

L’endométriose, souvent appelée «endo», se produit lorsque l’endomètre, les tissus riches en sang qui se développent dans l’utérus avant d’être expulsés chaque mois pendant les menstruations, se propage à d’autres organes voisins. Il provoque une douleur chronique et une infertilité. On estime que près de 200 millions de femmes dans le monde en souffrent.

« Endo est extrêmement débilitante », a déclaré Linda Giudice, MD, Ph.D., MSC, médecin-scientifique du Département d’obstétrique, de gynécologie et de sciences de la reproduction à l’UCSF et co-auteur de l’article.

« L’impact sur la vie des patients est énorme, de leurs relations interpersonnelles à la possibilité de occuper un emploi, d’avoir une famille et de maintenir le bien-être psychologique. »

L’étalon-or pour diagnostiquer l’endométriose est une chirurgie pour trouver des tissus endométriaux en dehors de l’utérus, et il est principalement traité avec des hormones pour supprimer le cycle menstruel, ou la chirurgie pour éliminer l’excès de tissu.

Mais tout le monde ne répond pas à l’hormonothérapie, qui peut avoir des effets secondaires débilitants. Même après la chirurgie, la condition peut se transformer. L’élimination de l’utérus est une mesure de dernière mise en dernier qui est généralement réservée aux femmes âgées; Mais certaines femmes continuent de ressentir de la douleur même après une hystérectomie.

Giudice s’est associé à Sirota pour tirer parti des données anonymisées des patients anonymisées du système de santé UC contre ENDO, ce qui peut varier considérablement d’un patient à l’autre. Giudice et Sirota sont tous deux des chercheurs principaux du Centre d’endométriose de l’UCSF-Stanford pour la découverte, l’innovation, la formation et l’engagement communautaire (ENACT).

« Ces données sont désordonnées; elles n’ont pas été collectées à des fins de recherche mais dans le but réel et humain d’aider les femmes qui ont besoin de soins », a déclaré Sirota.

« Nous avons eu les rares chances d’évaluer rigoureusement comment l’endométriose se présente à travers la population de patients de l’UCSF, puis de nous demander si ces observations étaient vraies avec les patients vus dans les autres centres de santé de l’UC. »

Les données relie les points pour comprendre l’endométriose

En utilisant des algorithmes développés pour la tâche, Umair Khan, un étudiant diplômé en bioinformatique dans le laboratoire de Sirota et le premier auteur de l’article, a chassé des connexions reliant l’endométriose au reste des antécédents de santé de chaque patient.

Il a comparé les patients ENDO avec des patients qui ne l’avaient pas et classé les patients atteints d’Endo en groupes en fonction des antécédents de santé partagés. Il a cartographié ses conclusions à partir des données de l’UCSF contre le reste des données de santé de l’UC pour voir s’ils ont résisté à la Californie.

« Nous avons trouvé plus de 600 corrélations entre l’endométriose et d’autres conditions », a déclaré Khan. « Celles-ci allaient de ce que nous savions ou soupçonnions déjà, comme l’infertilité, les maladies auto-immunes et le reflux acide, aux cancers inattendus, comme certains cancers, l’asthme et les maladies liées aux yeux. »

Certains patients ont eu des migraines, renforçant les études antérieures suggérant que les médicaments migraines pourraient aider à traiter l’endométriose.

« Dans le passé, des études comme celle-ci auraient été presque impossibles », a déclaré Tomiko Oskotsky, MD, enquêteur chez EFOR, professeur agrégé à l’UCSF BCHSI et co-auteur du journal. « Il y a seulement 12 ans, les dossiers de santé électroniques identifiés sont devenus disponibles à cette échelle. »

L’étude soutient la compréhension croissante de l’endométriose en tant que trouble «multi-systèmes» – une maladie résultant d’un dysfonctionnement dans tout le corps.

« C’est le type de données dont nous avons besoin pour déplacer l’aiguille, qui n’a pas évolué depuis des décennies », a déclaré Giudice. « Nous nous rapprochons enfin d’un diagnostic plus rapide et, finalement, nous espérons, un traitement adapté aux millions de femmes souffrant d’endométriose. »