{"id":6764,"date":"2025-05-24T22:55:49","date_gmt":"2025-05-24T20:55:49","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/un-outil-dapprentissage-automatique-peut-aider-a-diagnostiquer-surveiller-le-cancer-colorectal\/"},"modified":"2025-05-24T22:55:51","modified_gmt":"2025-05-24T20:55:51","slug":"un-outil-dapprentissage-automatique-peut-aider-a-diagnostiquer-surveiller-le-cancer-colorectal","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/un-outil-dapprentissage-automatique-peut-aider-a-diagnostiquer-surveiller-le-cancer-colorectal\/","title":{"rendered":"Un outil d’apprentissage automatique peut aider \u00e0 diagnostiquer, surveiller le cancer colorectal"},"content":{"rendered":"
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Les scientifiques visant \u00e0 faire progresser les diagnostics de cancer ont d\u00e9velopp\u00e9 un outil d’apprentissage automatique capable d’identifier les diff\u00e9rences de profil mol\u00e9culaire li\u00e9es au m\u00e9tabolisme entre les patients atteints de cancer colorectal et les personnes en bonne sant\u00e9.<\/p>\n

L’analyse des \u00e9chantillons biologiques de plus de 1 000 personnes a \u00e9galement r\u00e9v\u00e9l\u00e9 des changements m\u00e9taboliques associ\u00e9s \u00e0 l’\u00e9volution de la gravit\u00e9 de la maladie et aux mutations g\u00e9n\u00e9tiques connues pour augmenter le risque de cancer colorectal.<\/p>\n

L’\u0153uvre est publi\u00e9e dans la revue iMetaomics<\/i>.<\/p>\n

Bien qu’il y ait plus d’analyse \u00e0 venir, le \u00ab\u00a0pipeline de d\u00e9couverte de biomarqueurs\u00a0\u00bb qui en r\u00e9sulte est prometteur en tant que m\u00e9thode non invasive pour diagnostiquer le cancer colorectal et surveiller la progression de la maladie, a d\u00e9clar\u00e9 le Jiangjiang Zhu, auteur co-s\u00e9nior de l’\u00e9tude et professeur agr\u00e9g\u00e9 de sciences humaines \u00e0 l’Ohio State University.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous pensons qu’il s’agit d’un bon outil pour les diagnostics et la surveillance de la maladie, en particulier parce que l’analyse des biomarqueurs bas\u00e9e sur le m\u00e9tabolique pourrait \u00e9galement \u00eatre utilis\u00e9e pour surveiller l’efficacit\u00e9 du traitement\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu, \u00e9galement chercheur du programme de recherche sur la carcinogen\u00e8se et la chimiopr\u00e9vention du centre de cancer de l’Ohio State University.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Lorsqu’un patient prend un m\u00e9dicament contre le m\u00e9dicament B, en particulier pour le cancer, le temps est essentiel. S’il n’a pas une bonne r\u00e9ponse, nous voulons savoir que d\u00e8s que possible, nous pouvons changer le r\u00e9gime de traitement. Si les m\u00e9tabolites peuvent aider \u00e0 indiquer l’efficacit\u00e9 d’un traitement plus rapide que les m\u00e9thodes traditionnelles comme la pathologie ou les marqueurs de prot\u00e9ines, nous esp\u00e9rons \u00eatre de bons indicateurs pour les m\u00e9decins qui ne se soucient pas des patients.\u00a0\u00bb<\/p>\n

L’outil n’est pas destin\u00e9 \u00e0 remplacer la coloscopie comme l’\u00e9talon-or pour le d\u00e9pistage du cancer, a d\u00e9clar\u00e9 ZHU, et une \u00e9tude plus approfondie avec des \u00e9chantillons suppl\u00e9mentaires est pr\u00e9vue avant que le pipeline ne soit pr\u00eat pour la traduction dans un cadre clinique.<\/p>\n

Ce travail repr\u00e9sente \u00e9galement une avanc\u00e9e dans les techniques d’apprentissage automatique, combinant deux m\u00e9thodes \u00e9tablies pour concevoir la nouvelle plate-forme: une analyse partielle des moindres carr\u00e9s-discriminants (PLS-DA) pour la diff\u00e9renciation \u00e0 grosse image des profils mol\u00e9culaires, et un r\u00e9seau neuronal artificiel (ANN) qui, dans ce cas -, les mol\u00e9cules de pointe qui am\u00e9liorent la valeur pr\u00e9dictive de la plate-forme. L’\u00e9quipe a appel\u00e9 le biomarqueur qui en r\u00e9sulte Panda, abr\u00e9viation de PLS-Ann-da.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous avons pris le meilleur parti des deux mondes et les avons mis ensemble pour tirer parti de leurs forces et nous compl\u00e9ter pour compenser leurs faiblesses potentielles\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu. \u00ab\u00a0Nous examinions toutes sortes de possibilit\u00e9s de d\u00e9m\u00ealer les biomarqueurs qui pourraient \u00eatre pr\u00e9dictifs ou indicatifs de la progression de la maladie et des diff\u00e9rentes \u00e9tapes de la maladie. Cela nous a donn\u00e9 une forte confiance que cette m\u00e9thode a un grand potentiel pour les diagnostics futurs.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Deux ensembles de donn\u00e9es biologiques extraits d’\u00e9chantillons de sang ont \u00e9t\u00e9 analys\u00e9s: m\u00e9tabolites, produits de r\u00e9actions biochimiques qui d\u00e9composent les aliments pour produire de l’\u00e9nergie et remplissent d’autres fonctions essentielles et les transcrits, les lectures d’ARN des instructions d’ADN qui pr\u00e9disent les changements de prot\u00e9ines connexes.<\/p>\n

Les \u00e9chantillons biologiques sont une partie importante de la force de l’\u00e9tude, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu, car ils ont \u00e9t\u00e9 collect\u00e9s dans le cadre de grands projets de recherche: l’Ohio Colorectal Cancer Prevention Initiative (OCPI) et une Biobank de l’Ohio State Wexner Medical Center Clinical Laborator. Au total, 626 \u00e9chantillons provenaient de personnes atteintes d’un cancer colorectal, y compris des patients pr\u00e9sentant des mutations g\u00e9n\u00e9tiques \u00e0 haut risque. 402 autres \u00e9chantillons d’individus en bonne sant\u00e9 par \u00e2ge et entre les sexes ont \u00e9t\u00e9 obtenus par Jieli Li, auteur de l’\u00e9tude co-ennior et professeur agr\u00e9g\u00e9 de pathologie clinique au Coll\u00e8ge de m\u00e9decine de l’Ohio State.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous, en tant qu’humains, \u00e0 diff\u00e9rentes \u00e9tapes de notre vie, nous avons en fait une biochimie assez diff\u00e9rente\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu. \u00abCette pr\u00e9cieuse collection d’\u00e9chantillons nous a permis de diffuser une analyse m\u00e9tabolomique \u00e0 haut d\u00e9bit pour comprendre les changements mol\u00e9culaires des personnes qui n’ont pas de cancer \u00e0 des personnes qui ont un cancer, ainsi que de la maladie \u00e0 un stade sup\u00e9rieur au stade tardif.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Nous avons \u00e9galement des donn\u00e9es de patients atteints de mutations g\u00e9n\u00e9tiques que nous pouvons comparer aux donn\u00e9es m\u00e9tabolites pour examiner si les changements m\u00e9taboliques sont une indication de valeurs pr\u00e9dictives pour les mutations g\u00e9n\u00e9tiques. \u00c0 notre connaissance, c’est la premi\u00e8re fois que cela est fait \u00e0 cette port\u00e9e et \u00e0 cette \u00e9chelle parce que nous regardons litt\u00e9ralement des centaines de patients.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Les biomarqueurs sont difficiles \u00e0 compter pour les diagnostics dans diff\u00e9rentes populations en raison des nombreuses conditions qui affectent les profils mol\u00e9culaires dans les syst\u00e8mes vivants – de sorte que cette \u00e9tude met en \u00e9vidence plusieurs changements mol\u00e9culaires avec le potentiel, mais pas la certitude, dans l’\u00e9valuation de la pr\u00e9sence et de la progression du cancer colorectal dans un groupe de patients repr\u00e9sentatifs nationaux.<\/p>\n

Les voies de m\u00e9tabolisme li\u00e9es \u00e0 une famille de compos\u00e9s appel\u00e9s purines, qui sont n\u00e9cessaires pour la formation et la d\u00e9gradation de l’ADN, se sont d\u00e9marqu\u00e9es dans l’analyse car elles \u00e9taient globalement plus actives chez les patients canc\u00e9reux par rapport aux t\u00e9moins sains et \u00e9taient moins actifs dans les stades tumoraux plus avanc\u00e9s.<\/p>\n

\u00ab\u00a0C’est certainement une indication que ce biomarqueur peut \u00eatre associ\u00e9 aux m\u00e9canismes sous-jacents de la biologie du cancer\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu. \u00ab\u00a0Nous sommes prudemment optimistes en disant que nous faisons non seulement une d\u00e9couverte de biomarqueurs, mais que nous fournissons \u00e9galement des indices pour les enqu\u00eates m\u00e9canistes.\u00a0\u00bb<\/p>\n

L’\u00e9quipe pr\u00e9voit de continuer \u00e0 analyser les m\u00e9tabolites li\u00e9s \u00e0 diff\u00e9rents types de signaux biologiques pour affiner le pipeline Panda Biomarker.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Certains des marqueurs que nous avons identifi\u00e9s sont un peu capricieux, et il y a beaucoup de bruit au sein de ces signaux, mais nous avons pouss\u00e9 le champ vers l’avant pour d\u00e9velopper des biomarqueurs potentiels de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration et le nouveau pipeline bioinformatique pour le diagnostic et la surveillance du cancer colorectal\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Zhu.<\/p>\n

Les co-auteurs suppl\u00e9mentaires incluent le premier auteur Rui Xu, Hyein Jung, Fouad Choueiry, Shizi Zhang, Rachel Pearlman et Ning Jin, tous de l’Ohio State; et Heather Hampel du City of Hope National Cancer Center.<\/p>\n

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