{"id":5998,"date":"2025-04-24T02:57:36","date_gmt":"2025-04-24T00:57:36","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/lensemble-de-donnees-arn-a-longue-lecture-offre-750-millions-de-lectures-sur-14-lignees-cellulaires-humaines-pour-une-etude-de-maladie\/"},"modified":"2025-04-24T02:57:38","modified_gmt":"2025-04-24T00:57:38","slug":"lensemble-de-donnees-arn-a-longue-lecture-offre-750-millions-de-lectures-sur-14-lignees-cellulaires-humaines-pour-une-etude-de-maladie","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/lensemble-de-donnees-arn-a-longue-lecture-offre-750-millions-de-lectures-sur-14-lignees-cellulaires-humaines-pour-une-etude-de-maladie\/","title":{"rendered":"L’ensemble de donn\u00e9es ARN \u00e0 longue lecture offre 750 millions de lectures sur 14 lign\u00e9es cellulaires humaines pour une \u00e9tude de maladie"},"content":{"rendered":"
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Une \u00e9quipe de scientifiques dirig\u00e9e par l’A * Star Genome Institute de Singapour (A * Star SIG) a publi\u00e9 l’un des ensembles de donn\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age d’ARN les plus grands et les plus complets du monde, s’adressant \u00e0 un goulot d’\u00e9tranglement de longue date dans la recherche sur les maladies.<\/p>\n

Avec plus de 750 millions de lectures d’ARN de long sur 14 lign\u00e9es cellulaires humaines, l’ensemble de donn\u00e9es Singapore Nanopore Expression (SG-NEX) est con\u00e7u pour aider les chercheurs \u00e0 d\u00e9coder la complexit\u00e9 de l’ARN avec une plus grande pr\u00e9cision, jetant les bases des diagnostics et th\u00e9rapies de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration. L’\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e dans M\u00e9thodes de nature<\/i> en mars 2025.<\/p>\n

D\u00e9verrouiller l’image compl\u00e8te de l’ARN<\/h2>\n

Bien qu’il soit l’\u00e9pine dorsale de la transcriptomique moderne, le s\u00e9quen\u00e7age traditionnel de l’ARN \u00e0 lecture abr\u00e9g\u00e9e ne parvient souvent pas \u00e0 capturer des mol\u00e9cules d’ARN pleine longueur et des variations complexes, telles que les mod\u00e8les d’\u00e9pissage, les transcrits de fusion et les modifications chimiques sp\u00e9cifiques qui influencent la progression de la maladie comme le cancer. Cela limite son utilit\u00e9 dans la d\u00e9tection des biomarqueurs cliniquement pertinents.<\/p>\n

SG-NEX surmonte ces limitations en utilisant le s\u00e9quen\u00e7age d’ARN \u00e0 lecture longue, ce qui permet d’observer la structure de s\u00e9quence compl\u00e8te de l’ARN directement. Cela offre des informations biologiques plus profondes tout en r\u00e9duisant les angles morts analytiques, qui sont des \u00e9tapes cl\u00e9s pour d\u00e9couvrir de nouveaux biomarqueurs et d\u00e9velopper de meilleurs traitements plus pr\u00e9cis.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Imaginez que vous avez un livre o\u00f9 chaque page est d\u00e9chir\u00e9e en fragments\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 Chen Ying, scientifique principal dans un * star GIS. \u00ab\u00a0C’est ce qui se passe avec le s\u00e9quen\u00e7age de l’ARN \u00e0 lecture courte, ce qui vous oblige \u00e0 reconstruire l’histoire \u00e0 partir de phrases dispers\u00e9es. Certains d\u00e9tails peuvent \u00eatre perdus, et il est facile de faire des erreurs.<\/p>\n

\u00ab\u00a0En revanche, le s\u00e9quen\u00e7age d’ARN \u00e0 longue lecture vous permet de lire le livre \u00e0 l’aide de pages compl\u00e8tes ou m\u00eame de chapitres \u00e0 la fois.<\/p>\n

Alors que l’industrie des sciences de la vie se double de la m\u00e9decine de pr\u00e9cision, les chercheurs et les soci\u00e9t\u00e9s de biotechnologie ont besoin d’outils fiables et haute r\u00e9solution pour identifier de nouveaux marqueurs de maladies et des cibles th\u00e9rapeutiques.<\/p>\n

SG-NEX \u00e9tait sp\u00e9cialement con\u00e7u pour combler cette lacune avec son ensemble de donn\u00e9es \u00e0 acc\u00e8s libre et ses ressources d’analyse comparative, permettant \u00e0 l’industrie de mieux analyser Les d\u00e9cideurs politiques investissent dans des strat\u00e9gies de pr\u00e9cision g\u00e9nomique.<\/p>\n

Conduire l’innovation gr\u00e2ce \u00e0 la collaboration pour un impact mondial<\/h2>\n

Lanc\u00e9 en 2018, le SG-NEX est le r\u00e9sultat d’une \u00e9troite collaboration avec des experts d’un * star SIG, de la Duke-Nus Medical School, du National Cancer Center Singapore, d’un Institut des sciences du cancer de Singapour, du National University Cancer Institute of Singapour, du Walter et de l’Institut Eliza Hall of Medical Research, du Garvan Institute of Medical Research et du Peter MacCallum Center.<\/p>\n

\u00ab\u00a0D\u00e8s le d\u00e9but, nous avons con\u00e7u le projet SG-NEX avec une strat\u00e9gie rapide de version de donn\u00e9es d’acc\u00e8s ouvert pour maximiser son utilit\u00e9.<\/p>\n

Fa\u00e7onner l’avenir de la recherche sur l’ARN<\/h2>\n

L’\u00e9quipe SG-NEX s’efforce d\u00e9sormais d’amplifier davantage son impact en d\u00e9veloppant des outils aliment\u00e9s par l’IA pour la d\u00e9tection automatis\u00e9e des fonctionnalit\u00e9s d’ARN, en \u00e9largissant l’acc\u00e8s global aux donn\u00e9es et en promouvant la normalisation de protocoles \u00e0 lutte longue, qui sont des facteurs cl\u00e9s pour l’adoption clinique.<\/p>\n

Le Dr Wan Yue, directeur ex\u00e9cutif, A * Star SIG, a d\u00e9clar\u00e9: \u00ab\u00a0En combinant une g\u00e9n\u00e9ration de donn\u00e9es \u00e0 grande \u00e9chelle, une analyse d’analyse d’ant\u00e9c\u00e9dents rigoureuse et des infrastructures en libre acc\u00e8s, SG-NEX fa\u00e7onne l’avenir de la recherche sur l’ARN. Elle nous rapproche de la compr\u00e9hension de la fa\u00e7on dont l’ARN influence la sant\u00e9 et la maladie, et comment nous pouvons exploiter cette connaissance pour am\u00e9liorer la vie.\u00a0\u00bb<\/p>\n

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