{"id":4204,"date":"2025-02-11T06:00:30","date_gmt":"2025-02-11T05:00:30","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/la-fda-efface-le-test-de-septicemie-qui-reduit-considerablement-le-temps-de-diagnostic-de-la-vie-ou-de-la-mort\/"},"modified":"2025-02-11T06:00:31","modified_gmt":"2025-02-11T05:00:31","slug":"la-fda-efface-le-test-de-septicemie-qui-reduit-considerablement-le-temps-de-diagnostic-de-la-vie-ou-de-la-mort","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/la-fda-efface-le-test-de-septicemie-qui-reduit-considerablement-le-temps-de-diagnostic-de-la-vie-ou-de-la-mort\/","title":{"rendered":"La FDA efface le test de septic\u00e9mie qui r\u00e9duit consid\u00e9rablement le temps de diagnostic de la vie ou de la mort"},"content":{"rendered":"<div>\n<div class=\"article-gallery lightGallery\">\n<div data-thumb=\"https:\/\/scx1.b-cdn.net\/csz\/news\/tmb\/2025\/fda-clears-sepsis-test.jpg\" data-src=\"https:\/\/scx2.b-cdn.net\/gfx\/news\/hires\/2025\/fda-clears-sepsis-test.jpg\" data-sub-html=\"Purvesh Khatri. Credit: Stanford Medicine\">\n<figure class=\"article-img\">\n<\/figure><\/div>\n<\/div>\n<p>La septic\u00e9mie, un dysfonctionnement des organes potentiellement mortel, est responsable d&rsquo;une estimation de 1 d\u00e9c\u00e8s sur 5 dans le monde et de 1 d\u00e9c\u00e8s sur 3 qui survient dans un h\u00f4pital am\u00e9ricain. Cela se produit en raison d&rsquo;une r\u00e9ponse immunitaire d\u00e9r\u00e9gul\u00e9e \u00e0 l&rsquo;infection, et son taux de mortalit\u00e9 \u00e9lev\u00e9 est en corr\u00e9lation avec la difficult\u00e9 de diagnostiquer rapidement et de s&rsquo;attaquer de mani\u00e8re appropri\u00e9e \u00e0 l&rsquo;origine de l&rsquo;infection, que ce soit bact\u00e9rien, viral ou un autre pathog\u00e8ne. Les m\u00e9thodes actuelles peuvent retarder cette d\u00e9termination de la vie ou de la mort pendant aussi longtemps que trois jours.<\/p>\n<p>Entrez dans le Stanford Medicine Lab de Purvesh Khatri, o\u00f9 un test s&rsquo;est d\u00e9velopp\u00e9 pour r\u00e9duire cette p\u00e9riode \u00e0 environ 30 minutes &#8211; une avancement qui pourrait \u00eatre transformateur pour des millions de patients chaque ann\u00e9e &#8211; a \u00e9t\u00e9 \u00e9limin\u00e9 par la Food and Drug Administration en janvier.<\/p>\n<p>Khatri, Ph.D., membre du corps professoral de l&rsquo;Institut pour l&rsquo;immunit\u00e9, la transplantation et l&rsquo;infection et le D\u00e9partement de m\u00e9decine, affirme que si la septic\u00e9mie d&rsquo;un patient est caus\u00e9e par une infection bact\u00e9rienne, chaque heure qui passe avant que les antibiotiques ne soient administr\u00e9s augmentent le risque de mortalit\u00e9 de 6% \u00e0 8%. En cons\u00e9quence, les m\u00e9decins du service des urgences prescrivent souvent des antibiotiques avant m\u00eame que l&rsquo;infection ait \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9e, au cas o\u00f9 elle serait bact\u00e9rienne.<\/p>\n<p>Si le v\u00e9ritable coupable est un virus, cependant, le traitement antibiotique peut \u00eatre contre-productif car il peut cr\u00e9er un environnement favorable pour les bact\u00e9ries r\u00e9sistantes aux antibiotiques. Et si la cause est une inflammation st\u00e9rile, ni bact\u00e9rien ni viral mais autre chose &#8211; li\u00e9 au cancer, \u00e0 la chirurgie, aux caillots sanguins ou aux blessures internes, par exemple &#8211; le traitement du traitement peut \u00e9galement \u00eatre catastrophique.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Le temps est de l&rsquo;essence dans le bon diagnostic de septic\u00e9mie\u00a0\u00bb, explique Khatri. \u00ab\u00a0Les m\u00e9decins du service des urgences ont \u00e9t\u00e9 entrav\u00e9s par la n\u00e9cessit\u00e9 d&rsquo;attendre si longtemps pour identifier l&rsquo;infection d&rsquo;un patient comme virale ou bact\u00e9rien.<\/p>\n<p>En 2016, Khatri, Tim Sweeney, MD, Ph.D., et Jonathan Romanowsky, ont cofond\u00e9 une entreprise, Inflammatix, pour d\u00e9velopper une plate-forme pour le test de septic\u00e9mie. Appel\u00e9e Triv\u00e9rit\u00e9, le test \u00e9value un \u00e9chantillon de sang pour 29 g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans la pr\u00e9sence, le type et la gravit\u00e9 de l&rsquo;infection. Les signatures g\u00e9n\u00e9tiques qui constituent la fondation du test ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es par Khatri \u00e0 Stanford.<\/p>\n<p>La r\u00e9cente autorisation de la FDA marque non seulement une \u00e9tape importante vers la r\u00e9alisation d&rsquo;un outil potentiellement r\u00e9volutionnaire, il montre \u00e9galement qu&rsquo;une technique d&rsquo;apprentissage machine autrefois douloureuse utilis\u00e9e pour cr\u00e9er le test peut aider \u00e0 d\u00e9velopper des solutions cliniques r\u00e9elles \u00e0 des d\u00e9fis m\u00e9dicaux intraitables . Cette interview avec Khatri a \u00e9t\u00e9 \u00e9dit\u00e9e pour la longueur et la clart\u00e9.<\/p>\n<h2>Pourquoi la septic\u00e9mie a-t-elle \u00e9t\u00e9 si difficile pour les m\u00e9decins de diagnostiquer?<\/h2>\n<p>Jusqu&rsquo;\u00e0 r\u00e9cemment, les outils de diagnostic se sont concentr\u00e9s sur la recherche du pathog\u00e8ne qui a provoqu\u00e9 la septic\u00e9mie. Mais le syst\u00e8me immunitaire a \u00e9volu\u00e9 express\u00e9ment pour garder les agents pathog\u00e8nes hors de la circulation sanguine parce qu&rsquo;ils sont si mortels l\u00e0-bas, ce qui rend extr\u00eamement difficile de trouver un agent pathog\u00e8ne dans les \u00e9chantillons de sang.<\/p>\n<p>Une complication suppl\u00e9mentaire est que la septic\u00e9mie peut \u00eatre soit une r\u00e9action trop z\u00e9l\u00e9e du syst\u00e8me immunitaire \u00e0 l&rsquo;\u00e9chelle du corps \u00e0 l&rsquo;infection, soit elle peut \u00eatre l&rsquo;inverse: une r\u00e9ponse insuffisante. Pour un homme ob\u00e8se plus \u00e2g\u00e9 avec une immunosuppression, par exemple, la septic\u00e9mie est plus susceptible d&rsquo;\u00eatre caus\u00e9e par l&rsquo;incapacit\u00e9 du corps \u00e0 r\u00e9pondre suffisamment \u00e0 l&rsquo;infection.<\/p>\n<p>Les gens ont tendance \u00e0 consid\u00e9rer la septic\u00e9mie comme un probl\u00e8me binaire, que les diagnostics sont soit vous avez une septic\u00e9mie, soit vous ne le faites pas. Mais quand vous regardez la pratique clinique, ce n&rsquo;est pas la bonne question. La vraie question clinique tombe le long de deux axes: (1) y a-t-il une infection ou non? Et quand il y en a, est-ce bact\u00e9rien ou viral? et (2) \u00e0 quel point l&rsquo;infection d&rsquo;un patient est grave, quelle que soit sa cause sous-jacente?<\/p>\n<h2>Quelle a \u00e9t\u00e9 la cl\u00e9 ou l&rsquo;innovation cl\u00e9 qui a rendu le nouveau test possible?<\/h2>\n<p>Les chercheurs avaient d\u00e9j\u00e0 essay\u00e9 d&rsquo;utiliser des transcriptomiques &#8211; l&rsquo;\u00e9tude des copies des instructions d&rsquo;ARN qui indiquent aux cellules quoi faire qui sont produites par le g\u00e9nome dans des conditions sp\u00e9cifiques, fournissant un aper\u00e7u de l&rsquo;expression et de la r\u00e9gulation des g\u00e8nes &#8211; pour trouver des profils d&rsquo;activation des g\u00e8nes pour l&rsquo;infection. Mais trouver un signal qui se g\u00e9n\u00e9ralise \u00e0 diff\u00e9rentes populations dans diff\u00e9rentes conditions s&rsquo;est av\u00e9r\u00e9 extr\u00eamement difficile.<\/p>\n<p>En effet, ces \u00e9tudes ont \u00e9t\u00e9 men\u00e9es sur des populations \u00e9troites &#8211; par exemple, les enfants des services d&rsquo;urgence de l&rsquo;h\u00f4pital au Kansas. Mais cette m\u00eame signature d&rsquo;activation ne fonctionnerait pas, par exemple, les personnes \u00e2g\u00e9es dans une unit\u00e9 de soins intensifs en Ha\u00efti.<\/p>\n<p>Nous savions que le diagnostic devrait fonctionner dans des environnements cliniques h\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes et r\u00e9els. Mais l&rsquo;inscription d&rsquo;une large population de patients \u00e0 \u00e9tudier \u00e9tait intimidante logistique, en plus d&rsquo;\u00eatre prohibitive et prend du temps. Mon \u00ab\u00a0aha!\u00a0\u00bb Le moment \u00e9tait de r\u00e9aliser que nous pouvions utiliser des donn\u00e9es qui existent d\u00e9j\u00e0 dans le domaine public.<\/p>\n<p>\u00c9tant donn\u00e9 que tout le monde \u00e9chantillonne diff\u00e9rentes populations de patients pour ses \u00e9tudes, collectivement, ces donn\u00e9es repr\u00e9senteraient l&rsquo;h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 du monde r\u00e9el dont nous avions besoin: diff\u00e9rents \u00e2ges, races, sexes, ethnies, habitudes alimentaires, comorbidit\u00e9s, souches pathog\u00e8nes, etc. Tout le monde a consid\u00e9r\u00e9 cette h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 comme une mal\u00e9diction, mais nous l&rsquo;avons vu comme une b\u00e9n\u00e9diction.<\/p>\n<p>Nous avons utilis\u00e9 des m\u00e9thodes que j&rsquo;avais d\u00e9velopp\u00e9es pour tirer parti de l&rsquo;h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 de ces donn\u00e9es pour trouver les signatures immunitaires robustes qui se g\u00e9n\u00e9ralisent \u00e0 de larges populations de patients dans toutes les diff\u00e9rentes conditions pour identifier la pr\u00e9sence, le type et la gravit\u00e9 d&rsquo;une infection. Ils forment le fondement du test de septic\u00e9mie.<\/p>\n<p>La m\u00e9thode statistique que nous avons appliqu\u00e9e \u00e0 tous ces ensembles de donn\u00e9es m\u00e9dicales divergentes a pr\u00e8s de 50 ans. Notre principale innovation \u00e9tait d&rsquo;\u00e9largir les hypoth\u00e8ses sur le moment o\u00f9 cette m\u00e9thode pouvait \u00eatre appliqu\u00e9e efficacement.<\/p>\n<p>\u00c0 l&rsquo;origine, les personnes ne sugg\u00e9raient que des \u00e9tudes qui \u00e9taient approximativement les m\u00eames devraient \u00eatre combin\u00e9es. Mais nous avons combin\u00e9 des \u00e9tudes aussi diff\u00e9rentes que possible les uns des autres pour trouver des signaux qui ont persist\u00e9 \u00e0 travers toute l&rsquo;h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9. Nous avons eu une h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 sans pr\u00e9c\u00e9dent; Nous n&rsquo;avions pas besoin de recruter de patients; Et nous avons utilis\u00e9 des donn\u00e9es publiques gratuites, pr\u00e9existantes.<\/p>\n<p>Cela ressemble \u00e0 une solution intelligente \u00e0 un probl\u00e8me apparemment insoluble.<\/p>\n<p>Eh bien, tout le monde n&rsquo;a pas aim\u00e9 l&rsquo;id\u00e9e au d\u00e9part. En 2016, <i>The New England Journal of Medicine<\/i> Dirig\u00e9 un \u00e9ditorial appelant ceux qui utilisent des donn\u00e9es publiques \u00ab\u00a0Research Parasites\u00a0\u00bb, qui ne comprennent pas tr\u00e8s bien les ensembles de donn\u00e9es originaux. Mais nous nous sommes concentr\u00e9s sur la mise \u00e0 profit de l&rsquo;h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 librement disponible. Quoi qu&rsquo;il en soit, nous sommes pass\u00e9s du scepticisme profond \u00e0 l&rsquo;autorisation de la FDA!<\/p>\n<h2>Comment avez-vous transform\u00e9 ces informations, ainsi que vos m\u00e9thodes d&rsquo;apprentissage automatique, en une plate-forme de test r\u00e9elle?<\/h2>\n<p>\u00c0 cette \u00e9poque, il n&rsquo;y avait pas de plate-forme qui pouvait mesurer assez rapidement des dizaines de g\u00e8nes au point de soins pour que les m\u00e9decins ne se contentent pas de commencer et de commencer \u00e0 administrer des antibiotiques comme d&rsquo;habitude.<\/p>\n<p>Nous avons d\u00e9cid\u00e9 de d\u00e9marrer une entreprise et de construire la plate-forme nous-m\u00eames. Tim Sweeney \u00e9tait un r\u00e9sident de la chirurgie g\u00e9n\u00e9rale \u00e0 Stanford et un postdoc dans mon laboratoire. En 2017, il a quitt\u00e9 tout ce qu&rsquo;il avait ici pour d\u00e9marrer une entreprise et construire la plate-forme. Le reste est de l&rsquo;histoire!<\/p>\n<h2>Dites-moi plus sur la cr\u00e9ation du test<\/h2>\n<p>Apr\u00e8s avoir compil\u00e9 autant de donn\u00e9es publiques que nous avons pu trouver de diff\u00e9rents pays, races et ethnies &#8211; des groupes d&rsquo;\u00e2ge; arri\u00e8re-plans g\u00e9n\u00e9tiques; Et diff\u00e9rentes souches pathog\u00e8nes &#8211; nous avons demand\u00e9: \u00ab\u00a0Quel est l&rsquo;ensemble des g\u00e8nes qui change toujours dans la m\u00eame direction si vous avez une infection bact\u00e9rienne, ou si vous avez une infection virale, ou si vous avez probablement un r\u00e9sultat s\u00e9v\u00e8re de la septic\u00e9mie?\u00a0\u00bb<\/p>\n<p>Les m\u00e9thodes d&rsquo;apprentissage automatique que nous avons d\u00e9velopp\u00e9es ont trouv\u00e9 29 g\u00e8nes qui changent toujours &#8211; dans toutes ces diff\u00e9rentes conditions et dans toutes ces diff\u00e9rentes populations &#8211; dans les m\u00eames directions.<\/p>\n<p>Le test fournit trois scores pour r\u00e9pondre \u00e0 trois questions: y a-t-il une infection? Si oui, l&rsquo;agent pathog\u00e8ne est-il une bact\u00e9rie ou un virus? Et \u00e0 quel point l&rsquo;infection est-elle grave? Dans les 30 minutes, un m\u00e9decin des urgences sait traiter pour les bact\u00e9ries ou pour un virus, et s&rsquo;il faut admettre le patient ou les renvoyer chez eux.<\/p>\n<h2>Quelle est la pr\u00e9cision du test?<\/h2>\n<p>Chacune des trois scores est exprim\u00e9e comme tr\u00e8s faible, faible, mod\u00e9r\u00e9e, \u00e9lev\u00e9e ou tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9e. Lorsque vous regardez les tr\u00e8s hauts ou les tr\u00e8s bas, dans chacune des trois scores, nos sensibilit\u00e9s et nos sp\u00e9cificit\u00e9s sont sup\u00e9rieures \u00e0 95%.<\/p>\n<p>\u00c9galement tr\u00e8s important d&rsquo;un point de vue clinique, nous pouvons r\u00e9duire le nombre de faux n\u00e9gatifs dans l&rsquo;identification des patients gravement malades. Un faux n\u00e9gatif serait si un m\u00e9decin examine quelqu&rsquo;un dans le service des urgences et d\u00e9cide qu&rsquo;il n&rsquo;a pas besoin de soins de niveau USI. Si ce patient se retrouvait en USI, ou s&rsquo;il mourait, ce serait un faux n\u00e9gatif.<\/p>\n<p>Vingt-six personnes sur 1 200 qui se sont inscrites \u00e0 l&rsquo;\u00e9tude pour l&rsquo;autorisation de la FDA n&rsquo;ont pas re\u00e7u de soins au niveau de l&rsquo;USI, mais sont d\u00e9c\u00e9d\u00e9s plus tard. Parmi les 26 ans, notre test aurait identifi\u00e9 18 comme \u00e9tant suffisamment malade pour admettre les soins intensifs. En d&rsquo;autres termes, lorsque la pratique clinique actuelle a environ un taux de faux n\u00e9gatif de 2%, le n\u00f4tre n&rsquo;est que de 0,5%.<\/p>\n<h2>Essayez-vous toujours d&rsquo;am\u00e9liorer ces chiffres?<\/h2>\n<p>Inflammatix continue d&rsquo;am\u00e9liorer le test. Dans mon laboratoire, nous sommes pass\u00e9s au prochain d\u00e9fi &#8211; en identifiant le traitement immunitaire correct. Gr\u00e2ce au test de triv\u00e9rit\u00e9, vous pourrez \u00eatre diagnostiqu\u00e9 rapidement et avec pr\u00e9cision. Mais si le test dit que vous avez une septic\u00e9mie, nous ne savons toujours pas n\u00e9cessairement quel traitement est optimal.<\/p>\n<h2>Cette autorisation de la FDA d\u00e9place s\u00fbrement le test de septic\u00e9mie beaucoup plus pr\u00e8s de la clinique. Mais est-ce important pour d&rsquo;autres raisons?<\/h2>\n<p>Il y a treize ans, lorsque je suis devenu professeur adjoint, j&rsquo;ai r\u00e9alis\u00e9 qu&rsquo;avoir acc\u00e8s \u00e0 une h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 du monde r\u00e9el repr\u00e9sent\u00e9 dans les donn\u00e9es accessibles au public nous permettrait de d\u00e9velopper de nouveaux types de diagnostics qui sont g\u00e9n\u00e9ralisables \u00e0 une large population de patients.<\/p>\n<p>Comme je l&rsquo;ai dit, \u00e0 cette \u00e9poque, nous avons fait face \u00e0 beaucoup de scepticisme. Nous sommes pass\u00e9s de ce scepticisme \u00e0 la cr\u00e9ation d&rsquo;un test r\u00e9volutionnaire qui a re\u00e7u l&rsquo;autorisation de la FDA. Il s&rsquo;agit d&rsquo;une preuve de notre concept et, pensons-nous, le d\u00e9but de la fin du scepticisme selon lequel l&rsquo;analyse des donn\u00e9es publiques peut conduire \u00e0 d&rsquo;importants diagnostics de point de service approuv\u00e9s par la FDA.<\/p>\n<p>                                        <!-- print only --><\/p><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La septic\u00e9mie, un dysfonctionnement des organes potentiellement mortel, est responsable d&rsquo;une estimation de 1 d\u00e9c\u00e8s<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":4205,"comment_status":"closed","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[86],"tags":[1379,1391,3964,447,1920,193,658,2074,216,1390,597],"class_list":["post-4204","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-les-maladies","tag-considerablement","tag-diagnostic","tag-efface","tag-fda","tag-mort","tag-qui","tag-reduit","tag-septicemie","tag-temps","tag-test","tag-vie","generate-columns","tablet-grid-50","mobile-grid-100","grid-parent","grid-50","resize-featured-image"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v23.4 - 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