{"id":3992,"date":"2025-02-02T14:04:31","date_gmt":"2025-02-02T13:04:31","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/la-numerisation-mutationnelle-inversee-offre-une-reponse-plus-rapide-aux-nouvelles-variantes-de-virus\/"},"modified":"2025-02-02T14:04:40","modified_gmt":"2025-02-02T13:04:40","slug":"la-numerisation-mutationnelle-inversee-offre-une-reponse-plus-rapide-aux-nouvelles-variantes-de-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/la-numerisation-mutationnelle-inversee-offre-une-reponse-plus-rapide-aux-nouvelles-variantes-de-virus\/","title":{"rendered":"La num\u00e9risation mutationnelle invers\u00e9e offre une r\u00e9ponse plus rapide aux nouvelles variantes de virus"},"content":{"rendered":"
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Les virus sont des ma\u00eetres d\u00e9guis\u00e9s. Lorsqu’ils sont pouss\u00e9s trop loin par notre syst\u00e8me immunitaire, ils envoient de nouvelles variantes de virus en jeu qui ne sont plus reconnues par les cellules immunitaires. Ils \u00e9chappent \u00e0 notre syst\u00e8me immunitaire en mutilant les structures virales reconnus par les anticorps.<\/p>\n

Afin d’adapter les vaccins \u00e0 de nouvelles variantes de virus circulantes aussi rapidement que possible, il est d’abord n\u00e9cessaire de savoir qui, parmi les nombreuses mutations, sont en fait responsables de l’\u00e9vasion immunitaire d’une nouvelle variante virale. Les chercheurs du Helmholtz Center for Infection Research (HZI), en collaboration avec la Hanover Medical School (MHH), ont d\u00e9velopp\u00e9 une m\u00e9thode appel\u00e9e balayage mutationnel inverse qui peut \u00eatre utilis\u00e9 pour d\u00e9tecter ces mutations rapidement et de mani\u00e8re fiable.<\/p>\n

L’\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e dans la revue Communications de la nature<\/i>.<\/p>\n

Les virus ont toutes sortes de trucs dans leurs manches. Il ne faut souvent pas longtemps pour que les agents pathog\u00e8nes tels que SARS-COV-2 s’adaptent et \u00e9chappent \u00e0 la reconnaissance immunitaire. Les virus ayant des mutations qui \u00e9chappent \u00e0 la reconnaissance immunitaire plus efficacement que le virus d’origine auront un avantage s\u00e9lectif et l’emporteront avec le temps, dominant de plus en plus le paysage de l’infection.<\/p>\n

\u00ab\u00a0If the new virus variant can successfully escape the immune response, it is no longer sufficient to have recovered from one of the previous variants or to have been vaccinated with a previously effective vaccine,\u00a0\u00bb says Prof. Luka Cicin-Sain, head of the Immunologie virale du d\u00e9partement au HZI.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Avec le d\u00e9veloppement des vaccins, nous jouons toujours \u00e0 la propagation de nouvelles variantes d’\u00e9vasion. C’est la nature m\u00eame de l’\u00e9volution des virus. N\u00e9anmoins, nous devons d\u00e9jouer les virus et r\u00e9duire leurs avantages, \u00e0 la fois pour les circulation actuellement et pour ceux qui sera l\u00e0 dans les futures pand\u00e9mies. \u00ab\u00a0<\/p>\n

Une identification rapide des mutations cruciales pour l’\u00e9vasion immunitaire permet une adaptation rapide des vaccins aux nouvelles variantes de virus. Dans leur \u00e9tude actuelle, l’\u00e9quipe dirig\u00e9e par Cicin-Sain pr\u00e9sente une nouvelle approche prometteuse pour faire exactement cela. Il est bas\u00e9 sur une m\u00e9thode pr\u00e9c\u00e9demment \u00e9tablie appel\u00e9e balayage mutationnel: chaque mutation trouv\u00e9e dans la nouvelle variante est introduite s\u00e9par\u00e9ment dans le virus d’origine pour g\u00e9n\u00e9rer une biblioth\u00e8que de mutants virus.<\/p>\n

Les effets de chaque mutation individuelle peuvent ainsi \u00eatre d\u00e9finis en comparant les mutants de la biblioth\u00e8que \u00e0 l’original et \u00e0 la nouvelle variante virale. Cependant, dans leur \u00e9tude, les chercheurs HZI ont modifi\u00e9 la proc\u00e9dure en introduisant les mutations une par une dans la nouvelle variante virus pour la faire ressembler au virus d’origine \u00e0 chaque position. Par cons\u00e9quent, ils ont utilis\u00e9 la m\u00e9thodologie \u00e0 l’envers, c’est pourquoi ils l’appelaient le balayage mutationnel invers\u00e9.<\/p>\n

Comment fonctionne la num\u00e9risation de la mutation<\/h2>\n

Quel est exactement le processus derri\u00e8re la num\u00e9risation mutationnelle inverse et comment l’\u00e9quipe de recherche a-t-elle proc\u00e9d\u00e9? Pour tester leur nouvelle approche, les scientifiques ont examin\u00e9 les variantes virales de SARS-COV-2 comme exemple. Ils voulaient d\u00e9couvrir les 33 mutations qui distinguent la variante du virus BA.2.86 de la variante BA.2 d’origine sont responsables de l’\u00e9vasion immunitaire.<\/p>\n

En utilisant des m\u00e9thodes g\u00e9n\u00e9tiques avanc\u00e9es, les chercheurs ont produit des pseudovirus dits, qui utilisent la prot\u00e9ine de pointe SARS-COV-2 pour entrer dans les cellules, mais sont incapables de se r\u00e9pliquer et sont donc inoffensives pour les humains et l’environnement. Les chercheurs sont partis de la nouvelle variante virale avec une \u00e9vasion immunitaire, c’est-\u00e0-dire BA.2.86.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Pour d\u00e9couvrir quelles mutations sont responsables de l’\u00e9vasion immunitaire de cette variante virale, nous avons cr\u00e9\u00e9 divers pseudovirus dans lesquels l’une des 33 mutations diff\u00e9rentes a \u00e9t\u00e9 invers\u00e9e, en direction du virus d’origine Ba.2\u00a0\u00bb, explique le Dr Najat Bdeir, Un scientifique du d\u00e9partement immunologie virale au HZI et premier auteur de l’\u00e9tude. Dans des exp\u00e9riences de cellules \u00e9tendues, les chercheurs ont ensuite \u00e9tudi\u00e9 la fa\u00e7on dont les pseudovirus respectifs pourraient \u00eatre combat\u00e9s par les cellules immunitaires. Pour ce faire, ils ont utilis\u00e9 des \u00e9chantillons \u00abde la vraie vie\u00bb.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Pour l’\u00e9tude, nous avons pu fournir des s\u00e9rums sanguins \u00e0 partir d’une cohorte de 40 personnes travaillant dans le secteur des soins de sant\u00e9\u00a0\u00bb, explique le professeur Georg Behrens du D\u00e9partement de rhumatologie et d’immunologie \u00e0 la Hanover Medical School. \u00ab\u00a0Les participants avaient \u00e9t\u00e9 vaccin\u00e9s \u00e0 plusieurs reprises, notamment avec le vaccin \u00e0 l’\u00e9poque qui a \u00e9t\u00e9 efficace contre Omicron XBB.1.5.\u00a0\u00bb<\/p>\n

\u00ab\u00a0 En arri\u00e8re, nous emm\u00e8ne vers l’avant ‘<\/h2>\n

En utilisant le balayage mutationnel invers\u00e9, les chercheurs ont identifi\u00e9 que trois mutations dans la prot\u00e9ine de pointe \u00e9taient responsables de l’\u00e9vasion immunitaire. Mais pourquoi est-il important de commencer par la nouvelle variante virale et d’inverser les mutations individuelles, appliquant ainsi le balayage mutationnel dans \u00ab\u00a0inverse\u00a0\u00bb?<\/p>\n

\u00ab\u00a0Ceci est important parce que nos cellules immunitaires sont tr\u00e8s diverses. Ils peuvent faire des anticorps qui se lient \u00e0 diff\u00e9rentes parties sur le virus et ainsi bloquer le processus d’infection\u00a0\u00bb, explique la cicine-Sain.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Si nous partons de la variante d’origine et ins\u00e9rons une mutation dans une zone qui est r\u00e9ellement reconnue par les anticorps, il existe une forte probabilit\u00e9 que les anticorps se liant \u00e0 une autre partie du virus reconna\u00eetront et neutraliseront le virus. La contribution r\u00e9elle de la mutation Pour \u00e9chapper immunitaire ne peut pas \u00eatre d\u00e9tect\u00e9 de mani\u00e8re ad\u00e9quate de cette mani\u00e8re.<\/p>\n

Les chercheurs esp\u00e8rent que leur nouvelle m\u00e9thode pourra \u00e9galement faire progresser et acc\u00e9l\u00e9rer le d\u00e9veloppement futur des vaccins. Avec le balayage mutationnel invers\u00e9, d’autres virus et leurs variantes pourraient \u00eatre analys\u00e9s pour les mutations responsables de l’\u00e9vasion immunitaire.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il serait \u00e9galement concevable d’utiliser cette nouvelle m\u00e9thode pour former l’apprentissage automatique et les mod\u00e8les d’IA pour pr\u00e9dire quelles mutations potentielles d’un virus pourraient conduire \u00e0 une \u00e9vasion immunitaire\u00a0\u00bb, explique Cicine-Sain. \u00ab\u00a0Si nous pouvions produire des vaccins bas\u00e9s sur des vaccins pr\u00e9-adapt\u00e9s, nous serions plus rapidement que le virus.\u00a0\u00bb<\/p>\n

En plus de l’immunologie virale du d\u00e9partement de Luka Cicin-Sain, le d\u00e9partement du professeur Wulf Blankenfeldt \u00ab\u00a0La structure et la fonction des prot\u00e9ines\u00a0\u00bb de HZI ont \u00e9galement \u00e9t\u00e9 impliqu\u00e9es dans cette \u00e9tude. Les scientifiques du Center for Infection Medicine (CIIM), le German Primate Center – Leibniz Institute for Primate Research et le Leibniz Institute DSMZ – German Collection de micro-organismes et de cultures cellulaires, ainsi que le Centre allemand de recherche sur les infections (DZIF) Expertise \u00e0 cette \u00e9tude.<\/p>\n

\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\tFourni par Helmholtz Center for Infection Research<\/p>\n

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Depuis plus de dix ans, j'explore et rapporte les histoires poignantes des individus confront\u00e9s \u00e0 ces d\u00e9fis, tout en sensibilisant le public aux traitements novateurs et aux progr\u00e8s scientifiques dans ce domaine. 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