{"id":2095,"date":"2024-11-13T18:05:20","date_gmt":"2024-11-13T17:05:20","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/"},"modified":"2024-11-13T18:05:23","modified_gmt":"2024-11-13T17:05:23","slug":"une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/","title":{"rendered":"Une \u00e9tude sur l\u2019apprentissage automatique remet en question le lien entre les bact\u00e9ries intestinales et les maladies"},"content":{"rendered":"<div>\n<div class=\"article-gallery lightGallery\">\n<div data-thumb=\"https:\/\/scx1.b-cdn.net\/csz\/news\/tmb\/2024\/diarrhea.jpg\" data-src=\"https:\/\/scx2.b-cdn.net\/gfx\/news\/hires\/2024\/diarrhea.jpg\" data-sub-html=\"Credit: Pixabay\/CC0 Public Domain\">\n<figure class=\"article-img\">\n<\/figure><\/div>\n<\/div>\n<p>De nombreuses maladies d\u2019origine bact\u00e9rienne, telles que les maladies inflammatoires de l\u2019intestin ou le cancer colorectal, sont associ\u00e9es \u00e0 une prolif\u00e9ration de bact\u00e9ries intestinales consid\u00e9r\u00e9es comme de mauvais acteurs. Mais lorsque les chercheurs ont utilis\u00e9 un algorithme d\u2019apprentissage automatique pour pr\u00e9dire la densit\u00e9 des microbes, appel\u00e9e charge microbienne, \u00e0 partir de leurs microbiomes intestinaux, ils ont d\u00e9couvert que les changements dans la charge microbienne, plut\u00f4t que dans la maladie, pourraient \u00eatre \u00e0 l\u2019origine de la pr\u00e9sence d\u2019esp\u00e8ces microbiennes associ\u00e9es \u00e0 la maladie. .<\/p>\n<p>Les chercheurs rapportent le 13 novembre 2024 dans la revue <i>Cellule<\/i> que les diff\u00e9rences dans la charge microbienne d&rsquo;un patient, qui s&rsquo;est av\u00e9r\u00e9e influenc\u00e9e par des facteurs allant de l&rsquo;\u00e2ge, du sexe, du r\u00e9gime alimentaire, du pays d&rsquo;origine et de l&rsquo;utilisation d&rsquo;antibiotiques, \u00e9taient un facteur cl\u00e9 pour les signatures bact\u00e9riennes dans les \u00e9chantillons f\u00e9caux.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Nous avons \u00e9t\u00e9 surpris de constater que de nombreuses esp\u00e8ces microbiennes, que l&rsquo;on croyait auparavant associ\u00e9es \u00e0 des maladies, \u00e9taient plus fortement expliqu\u00e9es par des changements dans la charge microbienne\u00a0\u00bb, explique Peer Bork du Laboratoire europ\u00e9en de biologie mol\u00e9culaire (EMBL) de Heidelberg, l&rsquo;un des principaux auteurs de l&rsquo;\u00e9tude. l&rsquo;\u00e9tude.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Cela indique que ces esp\u00e8ces sont principalement associ\u00e9es \u00e0 des sympt\u00f4mes tels que la diarrh\u00e9e et la constipation, plut\u00f4t que d&rsquo;\u00eatre directement li\u00e9es aux maladies elles-m\u00eames.\u00a0\u00bb<\/p>\n<p>La charge microbienne est reconnue depuis longtemps comme un facteur important dans la recherche sur le microbiome, mais l&rsquo;analyse \u00e0 grande \u00e9chelle a \u00e9t\u00e9 largement limit\u00e9e en raison du co\u00fbt \u00e9lev\u00e9 et de la forte intensit\u00e9 de main d&rsquo;\u0153uvre des m\u00e9thodes exp\u00e9rimentales, que les chercheurs ont surmont\u00e9es gr\u00e2ce \u00e0 une approche d&rsquo;apprentissage automatique.<\/p>\n<p>Ils ont d\u00e9velopp\u00e9 un mod\u00e8le de pr\u00e9diction de la charge microbienne f\u00e9cale bas\u00e9 sur la composition relative du microbiome et l&rsquo;ont appliqu\u00e9 \u00e0 un ensemble de donn\u00e9es m\u00e9tag\u00e9nomiques \u00e0 grande \u00e9chelle pour explorer sa variation en mati\u00e8re de sant\u00e9 et de maladie.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Mesurer la charge microbienne dans des \u00e9chantillons f\u00e9caux demande beaucoup d&rsquo;efforts et nous \u00e9tions heureux d&rsquo;avoir acc\u00e8s \u00e0 deux grands ensembles de donn\u00e9es m\u00e9tag\u00e9nomiques dans lesquels la charge microbienne avait \u00e9t\u00e9 mesur\u00e9e exp\u00e9rimentalement\u00a0\u00bb, explique Michael Kuhn, \u00e9galement de l&rsquo;EMBL et l&rsquo;autre auteur principal de l&rsquo;\u00e9tude.<\/p>\n<p>\u00ab\u00a0Avec notre approche, nous souhaitons g\u00e9n\u00e9raliser ces donn\u00e9es au profit d&rsquo;un domaine plus large et avec les outils que nous fournissons, la charge microbienne peut \u00eatre pr\u00e9dite pour toutes les \u00e9tudes sur le microbiome intestinal humain adulte.\u00a0\u00bb<\/p>\n<p>Les ensembles de donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par l&rsquo;\u00e9quipe pour la recherche sont des milliers de m\u00e9tag\u00e9nomes et de charges microbiennes mesur\u00e9es exp\u00e9rimentalement dans les projets GALAXY (Axe intestin-et-foie dans la fibrose h\u00e9patique alcoolique) et MicrobLiver de la Fondation Novo Nordisk. Ils ont \u00e9galement utilis\u00e9 des m\u00e9tag\u00e9nomes et des donn\u00e9es sur la charge microbienne provenant d\u2019une population d\u2019\u00e9tude MetaCardis pr\u00e9c\u00e9demment publique. Pour les ensembles de donn\u00e9es exploratoires, ils ont utilis\u00e9 des dizaines de milliers de m\u00e9tag\u00e9nomes issus d\u2019\u00e9tudes ant\u00e9rieures, notamment des populations du Japon et d\u2019Estonie.<\/p>\n<p>L&rsquo;\u00e9quipe reconna\u00eet les limites du travail. Parce que l\u2019analyse \u00e9tait bas\u00e9e uniquement sur les associations, ils n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 en mesure d\u2019\u00e9tablir une direction claire de causalit\u00e9, ni de fournir un aper\u00e7u m\u00e9caniste. De plus, la m\u00e9thode d\u00e9velopp\u00e9e s\u2019applique uniquement au microbiome intestinal humain. Diff\u00e9rents ensembles de donn\u00e9es de formation sont n\u00e9cessaires pour pr\u00e9dire la charge microbienne dans d\u2019autres habitats.<\/p>\n<p>Les recherches futures se concentreront sur les esp\u00e8ces microbiennes plus directement associ\u00e9es aux maladies, ind\u00e9pendamment de la charge microbienne, afin de mieux comprendre leur r\u00f4le dans l&rsquo;\u00e9tiologie des maladies et leur utilisation potentielle comme biomarqueurs. De plus, l\u2019adaptation de ce mod\u00e8le de pr\u00e9diction \u00e0 d\u2019autres environnements, tels que les microbiomes des oc\u00e9ans et des sols, pourrait fournir des informations suppl\u00e9mentaires sur l\u2019\u00e9cologie microbienne \u00e0 l\u2019\u00e9chelle mondiale.<\/p>\n<p>                                        <!-- print only --><\/p><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>De nombreuses maladies d\u2019origine bact\u00e9rienne, telles que les maladies inflammatoires de l\u2019intestin ou le cancer<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":2096,"comment_status":"closed","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[86],"tags":[1652,1169,159,48,2451,1651,49,2071,404,2450,2449,112,47],"class_list":["post-2095","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-les-maladies","tag-automatique","tag-bacteries","tag-entre","tag-etude","tag-intestinales","tag-lapprentissage","tag-les","tag-lien","tag-maladies","tag-question","tag-remet","tag-sur","tag-une","generate-columns","tablet-grid-50","mobile-grid-100","grid-parent","grid-50","resize-featured-image"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v23.4 - 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Mon engagement r\u00e9side dans l'espoir de cr\u00e9er une communaut\u00e9 inform\u00e9e et empathique, pr\u00eate \u00e0 soutenir ceux qui luttent contre ces \u00e9preuves.\",\"sameAs\":[\"https:\/\/rvh-synergie.org\/\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Une \u00e9tude sur l\u2019apprentissage automatique remet en question le lien entre les bact\u00e9ries intestinales et les maladies - RVH-Synergie.org","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/","og_locale":"fr_FR","og_type":"article","og_title":"Une \u00e9tude sur l\u2019apprentissage automatique remet en question le lien entre les bact\u00e9ries intestinales et les maladies - RVH-Synergie.org","og_description":"De nombreuses maladies d\u2019origine bact\u00e9rienne, telles que les maladies inflammatoires de l\u2019intestin ou le cancer","og_url":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/","og_site_name":"RVH-Synergie","article_published_time":"2024-11-13T17:05:20+00:00","article_modified_time":"2024-11-13T17:05:23+00:00","og_image":[{"width":1920,"height":1280,"url":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/wp-content\/uploads\/2024\/11\/1731517520_Une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien.jpg","type":"image\/jpeg"}],"author":"Charles Martinez","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"\u00c9crit par":"Charles Martinez","Dur\u00e9e de lecture estim\u00e9e":"4 minutes"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"Article","@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/#article","isPartOf":{"@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/"},"author":{"name":"Charles Martinez","@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/#\/schema\/person\/aa5ea98671fb4e8620f488a0795d2560"},"headline":"Une \u00e9tude sur l\u2019apprentissage automatique remet en question le lien entre les bact\u00e9ries intestinales et les maladies","datePublished":"2024-11-13T17:05:20+00:00","dateModified":"2024-11-13T17:05:23+00:00","mainEntityOfPage":{"@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/"},"wordCount":738,"publisher":{"@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/#organization"},"image":{"@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/wp-content\/uploads\/2024\/11\/1731517520_Une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien.jpg","keywords":["automatique","bact\u00e9ries","entre","\u00e9tude","intestinales","lapprentissage","Les","lien","maladies","question","remet","sur","une"],"articleSection":["Les maladies"],"inLanguage":"fr-FR"},{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/","url":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/une-etude-sur-lapprentissage-automatique-remet-en-question-le-lien-entre-les-bacteries-intestinales-et-les-maladies\/","name":"Une \u00e9tude sur l\u2019apprentissage automatique remet en question le lien entre les bact\u00e9ries intestinales et les maladies - 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