{"id":1899,"date":"2024-11-05T18:01:08","date_gmt":"2024-11-05T17:01:08","guid":{"rendered":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/des-scientifiques-developpent-un-test-pour-mieux-suivre-les-souches-de-coqueluche-au-milieu-dune-epidemie-en-australie\/"},"modified":"2024-11-05T18:01:11","modified_gmt":"2024-11-05T17:01:11","slug":"des-scientifiques-developpent-un-test-pour-mieux-suivre-les-souches-de-coqueluche-au-milieu-dune-epidemie-en-australie","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/rvh-synergie.org\/actualites\/des-scientifiques-developpent-un-test-pour-mieux-suivre-les-souches-de-coqueluche-au-milieu-dune-epidemie-en-australie\/","title":{"rendered":"Des scientifiques d\u00e9veloppent un test pour mieux suivre les souches de coqueluche au milieu d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie en Australie"},"content":{"rendered":"
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Des chercheurs de l’UNSW Sydney et de l’Universit\u00e9 de technologie de Sydney (UTS) ont d\u00e9velopp\u00e9 un nouveau test g\u00e9nomique capable d’identifier les souches sp\u00e9cifiques de la coqueluche (bact\u00e9rie Bordetella pertussis).<\/p>\n

Cette nouvelle technologie a permis de mieux comprendre deux pr\u00e9c\u00e9dentes \u00e9pid\u00e9mies de coqueluche en Australie et \u00e0 l’\u00e9tranger, dont les r\u00e9sultats ont \u00e9t\u00e9 publi\u00e9s dans le Journal de microbiologie clinique<\/i>.<\/p>\n

L’\u00e9quipe, dirig\u00e9e par le professeur Ruiting Lan de l’UNSW et le Dr Laurence Luu de l’UTS et de l’UNSW, esp\u00e8re utiliser l’analyse pour identifier la souche responsable de l’\u00e9pid\u00e9mie actuelle en Australie.<\/p>\n

En 2024, tous les \u00c9tats et territoires ont signal\u00e9 une augmentation des cas de coqueluche par rapport aux ann\u00e9es pr\u00e9c\u00e9dentes. Des informations d\u00e9taill\u00e9es sur la souche impliqu\u00e9e pourraient jouer un r\u00f4le crucial dans l\u2019am\u00e9lioration de la gestion de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie et du d\u00e9veloppement futur d\u2019un vaccin.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Cette \u00e9tude ouvre la voie \u00e0 une surveillance en temps r\u00e9el des souches de coqueluche, surmontant les limites actuelles des tests\u00a0\u00bb, d\u00e9clare le Dr Laurence Luu, charg\u00e9e de recherche au chancelier de l’UTS, qui a dirig\u00e9 l’\u00e9tude. \u00ab\u00a0Nos r\u00e9sultats fournissent des donn\u00e9es de base importantes pour comprendre comment la coqueluche a chang\u00e9 en Australie et pourraient \u00eatre utilis\u00e9es pour nous guider dans l’\u00e9pid\u00e9mie actuelle.\u00a0\u00bb<\/p>\n

La toux de 100 jours<\/h2>\n

La coqueluche est une maladie respiratoire grave dont les sympt\u00f4mes comprennent une toux persistante pouvant durer jusqu’\u00e0 100 jours. La maladie est hautement contagieuse, une personne infect\u00e9e pouvant la transmettre \u00e0 17 \u00e0 18 personnes sensibles sans vaccination.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Cela commence comme tous les autres sympt\u00f4mes du rhume et de la grippe\u00a0: nez qui coule, toux l\u00e9g\u00e8re et fi\u00e8vre l\u00e9g\u00e8re, mais avec le temps, donc au bout d’une semaine ou deux environ, cette toux commence \u00e0 devenir de plus en plus intense\u00a0\u00bb, explique le Dr. Luu, \u00e9galement ma\u00eetre de conf\u00e9rences associ\u00e9 \u00e0 l’\u00c9cole de biotechnologie et de sciences biomol\u00e9culaires de l’UNSW.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Cela peut provoquer des quintes de toux suivies d’une forte inhalation, qui est le bruit perceptible de la coqueluche que vous entendez.\u00a0\u00bb<\/p>\n

La vaccination contre la coqueluche est fortement recommand\u00e9e aux nourrissons et aux femmes enceintes, afin de r\u00e9duire le risque d’infection et de complications. La vaccination des personnes enceintes entre 20 et 32 \u200b\u200bsemaines offre une protection importante aux nouveau-n\u00e9s pendant leurs premiers mois les plus vuln\u00e9rables, avant qu\u2019ils ne soient \u00e9ligibles \u00e0 la vaccination.<\/p>\n

Mod\u00e8les d\u2019\u00e9pid\u00e9mie<\/h2>\n

Des recherches ant\u00e9rieures de l\u2019\u00e9quipe sugg\u00e8rent que la coqueluche pourrait \u00e9voluer sous la pression vaccinale, un peu comme nous l\u2019avons vu avec le COVID-19. \u00ab\u00a0Nos recherches ant\u00e9rieures sugg\u00e8rent que la coqueluche \u00e9volue contre le vaccin\u00a0\u00bb, explique le Dr Luu. \u00ab\u00a0Cela dit, le vaccin reste tr\u00e8s efficace pour prot\u00e9ger contre les maladies graves.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Les donn\u00e9es historiques montrent que malgr\u00e9 l\u2019utilisation g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9e du vaccin, les cas de coqueluche ont tendance \u00e0 augmenter tous les quatre \u00e0 cinq ans.<\/p>\n

Apr\u00e8s une \u00e9pid\u00e9mie en 2019, la fermeture des fronti\u00e8res et le confinement li\u00e9 au COVID-19 ont conduit \u00e0 un niveau record de cas de coqueluche. Cependant, une r\u00e9cente \u00e9pid\u00e9mie en Australie a entra\u00een\u00e9 environ 39 000 cas confirm\u00e9s en laboratoire, soit l’ann\u00e9e la plus \u00e9lev\u00e9e jamais enregistr\u00e9e depuis l’introduction des vaccins.<\/p>\n

Les rapports indiquent qu’en 2024, le nombre de cas a \u00e9t\u00e9 plus de 10 fois sup\u00e9rieur \u00e0 celui de l’ensemble de l’ann\u00e9e 2023, les enfants \u00e2g\u00e9s de 9 \u00e0 12 ans repr\u00e9sentant pr\u00e8s de 40 % de tous les cas notifi\u00e9s.<\/p>\n

\u00ab\u00a0La m\u00e9thode que nous avons d\u00e9velopp\u00e9e, connue sous le nom de test de s\u00e9quen\u00e7age mPCR, peut s\u00e9quencer directement l’ADN r\u00e9siduel de la coqueluche provenant d’un test PCR et n’a besoin que de quatre copies de l’ADN bact\u00e9rien pour fonctionner efficacement. Elle ne nous oblige pas \u00e0 cultiver les bact\u00e9ries\u00a0\u00bb, explique le Dr Laurence Luu.<\/p>\n

D\u00e9veloppement d’un test de s\u00e9quen\u00e7age pour la coqueluche<\/h2>\n

Pendant de nombreuses ann\u00e9es, la coqueluche a \u00e9t\u00e9 diagnostiqu\u00e9e par la culture de la bact\u00e9rie en cause, avant de passer aux tests PCR qui ne n\u00e9cessitent plus la culture (la culture) de la bact\u00e9rie vivante.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Ce changement dans la pratique du diagnostic signifie que nous ne r\u00e9cup\u00e9rons plus les bact\u00e9ries \u00e0 des fins de surveillance et que nous ne pouvons pas surveiller quelles souches circulent dans la communaut\u00e9, ni si elles sont toujours cibl\u00e9es par le vaccin ou les antibiotiques actuels\u00a0\u00bb, explique le Dr Luu.<\/p>\n

Pour donner un aper\u00e7u plus clair des souches \u00e0 l\u2019origine de la coqueluche, l\u2019\u00e9quipe a entrepris de d\u00e9velopper un test de souche tr\u00e8s sensible sans qu\u2019il soit n\u00e9cessaire de cultiver des bact\u00e9ries.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Habituellement, pour comprendre quelles souches circulent dans la communaut\u00e9, vous devez cultiver la bact\u00e9rie afin d’en avoir suffisamment pour s\u00e9quencer son ADN\u00a0\u00bb, explique le Dr Luu.<\/p>\n

Le s\u00e9quen\u00e7age de l’ADN sur les \u00e9couvillons cliniques de la coqueluche est un cocktail de toutes sortes d’ADN, provenant \u00e0 la fois de l’homme et de toutes les autres bact\u00e9ries des voies respiratoires humaines. \u00ab\u00a0En g\u00e9n\u00e9ral, cela rend le s\u00e9quen\u00e7age tr\u00e8s difficile\u00a0\u00bb, explique le Dr Luu.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Mais la m\u00e9thode que nous avons d\u00e9velopp\u00e9e, connue sous le nom de test de s\u00e9quen\u00e7age mPCR, peut s\u00e9quencer directement l’ADN r\u00e9siduel de la coqueluche provenant d’un test PCR et n’a besoin que de quatre copies de l’ADN bact\u00e9rien pour fonctionner efficacement. Cela ne nous oblige pas \u00e0 faire cro\u00eetre les bact\u00e9ries.<\/p>\n

L\u2019\u00e9quipe a test\u00e9 son test sur 178 \u00e9chantillons d\u2019ADN diagnostique restants provenant de toute l\u2019Australie provenant de deux \u00e9pid\u00e9mies pr\u00e9c\u00e9dentes, les \u00e9chantillons \u00e9tant collect\u00e9s entre 2010-2012 et 2019.<\/p>\n

Suivi des \u00e9pid\u00e9mies pr\u00e9c\u00e9dentes<\/h2>\n

L\u2019analyse des r\u00e9sultats a fourni des d\u00e9tails sans pr\u00e9c\u00e9dent sur l\u2019\u00e9volution des souches de coqueluche qui circulaient en Australie avant la pand\u00e9mie.<\/p>\n

L\u2019une des principales conclusions a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de 2012 \u00e9tait caract\u00e9ris\u00e9e par jusqu\u2019\u00e0 cinq souches ou lign\u00e9es diff\u00e9rentes de B. pertussis. \u00ab\u00a0Nous avons constat\u00e9 que les souches associ\u00e9es \u00e0 la grande \u00e9pid\u00e9mie de 2008-2012 avaient \u00e9volu\u00e9 pour ne plus produire l’un des trois composants cibl\u00e9s par le vaccin.\u00a0\u00bb<\/p>\n

En 2019, une seule de ces souches \u00e9tait devenue dominante.<\/p>\n

\u00ab\u00a0\u00c9tonnamment, nous avons \u00e9galement identifi\u00e9 un certain nombre de cas o\u00f9 l’infection n’\u00e9tait pas caus\u00e9e par la coqueluche, mais par une autre bact\u00e9rie \u00e9troitement apparent\u00e9e appel\u00e9e Bordetella holmesii\u00a0\u00bb, explique le Dr Luu.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Dans les laboratoires cliniques, les deux bact\u00e9ries partagent le m\u00eame marqueur diagnostique, mais ce que l’on constate, c’est qu’en 2019, il y avait en r\u00e9alit\u00e9 deux esp\u00e8ces qui \u00e9taient \u00e0 l’origine de l’infection, et m\u00eame des cas o\u00f9 elles \u00e9taient co-infect\u00e9es par deux bact\u00e9ries diff\u00e9rentes.<\/p>\n

\u00ab\u00a0Il est important de disposer de donn\u00e9es ant\u00e9rieures pour comprendre comment les bact\u00e9ries ont pu \u00e9voluer au fil du temps, par exemple si elles \u00e9voluent contre les vaccins ou d\u00e9veloppent une r\u00e9sistance aux antibiotiques.\u00a0\u00bb<\/p>\n

Surveillance de routine de la coqueluche<\/h2>\n

La r\u00e9f\u00e9rence en mati\u00e8re de suivi des \u00e9pid\u00e9mies de maladies est la COVID-19, explique le Dr Luu. \u00ab\u00a0Nous connaissions le moment exact auquel les souches delta et omicron ont commenc\u00e9 \u00e0 circuler, ce qui nous a aid\u00e9 \u00e0 continuer \u00e0 d\u00e9velopper le vaccin et \u00e0 r\u00e9agir avec des strat\u00e9gies appropri\u00e9es\u00a0\u00bb, dit-il.<\/p>\n

Bien que ce dernier article ait r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que leur test est efficace et sensible, les prochaines \u00e9tapes pour le Dr Luu et son \u00e9quipe consistent \u00e0 appliquer leurs techniques \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9mie actuelle.<\/p>\n

L’\u00e9quipe travaille avec des prestataires de services de pathologie pour convertir ce test en un outil de surveillance de routine de la sant\u00e9 publique afin de d\u00e9terminer quelles souches de coqueluche circulent dans la communaut\u00e9. \u00ab\u00a0En sachant quelles souches se transmettent dans la communaut\u00e9, cela nous permettra de rep\u00e9rer et de r\u00e9pondre plus rapidement aux \u00e9pid\u00e9mies.\u00a0\u00bb<\/p>\n

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